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tatum木蟲 (正式寫手)
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[求助]
關于DS對接時輔酶的處理 已有1人參與
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請教大家個問題,在使用discovery studio進行對接時,有些酶,例如醇脫氫酶,轉氨酶等,帶有輔酶NAD或者PLP,在對接的時候,怎么處理的? 例如轉氨酶 1M32,pdb中帶有PLP輔酶,這個輔酶和配體同時存在于活性口袋,在反應時要參與反應。 但是,我在對接的時候,如果保留PLP,再與其它配體進行對接,只有LiDock可以進行下去,Gold和CDock都會報錯,只有刪掉PLP之后才能繼續(xù)進行對接,但刪掉PLP的對接結果可能與實際情況差別很大。 請問大家是怎么做的,是不是我操作有誤? |

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木蟲 (正式寫手)

木蟲 (正式寫手)

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