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72219074

木蟲(chóng) (小有名氣)

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[交流] ECD 計(jì)算經(jīng)驗(yàn)小結(jié)

ECD計(jì)算在確定手性化合物的絕對(duì)構(gòu)型方面，已經(jīng)是非常成熟的方法了，即使影響因子非常低的雜志也要求計(jì)算ECD，從而確定絕對(duì)構(gòu)型。我們長(zhǎng)期為各大高校、科研單位提供這類計(jì)算服務(wù)，積累了一些經(jīng)驗(yàn)，分享如下：
1.構(gòu)象搜索時(shí)必須的，一般閾值設(shè)為3.0即可。
2.必須結(jié)合NOESY挑選合適的構(gòu)象，不然計(jì)算結(jié)果跟實(shí)驗(yàn)結(jié)果可能不吻合。
3.優(yōu)化時(shí)用常規(guī)基組如6-31G*就可以滿足。
4.計(jì)算激發(fā)態(tài)時(shí)，TD-B3LYP，真空條件多很多體系都能得到比較好結(jié)果，有個(gè)別體系，需要嘗試不同的方法，比如CAM-B3LYP，或者加上溶劑模型。
5.有些體系不管怎樣計(jì)算，都很難吻合的很好，這時(shí)候可以適當(dāng)提高能量閾值，比如設(shè)為5.0kcal/mol。
最后，歡迎感興趣的同行交流。Thanks a lot.

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林利彬1992

07002962

yxpv3202

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1樓 2019-06-25 09:05:45

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Oliy

新蟲(chóng) (正式寫手)

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回復(fù)此樓

13樓2019-06-26 12:06:00

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youngen7樓

2019-06-26 07:31 回復(fù)

72219074(金幣+5): 謝謝參與

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紫然若依11樓

2019-06-26 08:17 回復(fù)