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[交流]
ECD 計算經驗小結
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ECD計算在確定手性化合物的絕對構型方面,已經是非常成熟的方法了,即使影響因子非常低的雜志也要求計算ECD,從而確定絕對構型。我們長期為各大高校、科研單位提供這類計算服務,積累了一些經驗,分享如下: 1.構象搜索時必須的,一般閾值設為3.0即可。 2.必須結合NOESY挑選合適的構象,不然計算結果跟實驗結果可能不吻合。 3.優(yōu)化時用常規(guī)基組如6-31G*就可以滿足。 4.計算激發(fā)態(tài)時,TD-B3LYP,真空條件多很多體系都能得到比較好結果,有個別體系,需要嘗試不同的方法,比如CAM-B3LYP,或者加上溶劑模型。 5.有些體系不管怎樣計算,都很難吻合的很好,這時候可以適當提高能量閾值,比如設為5.0kcal/mol。 最后,歡迎感興趣的同行交流。Thanks a lot. |
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