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ECD 計算經(jīng)驗小結(jié)
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ECD計算在確定手性化合物的絕對構(gòu)型方面,已經(jīng)是非常成熟的方法了,即使影響因子非常低的雜志也要求計算ECD,從而確定絕對構(gòu)型。我們長期為各大高校、科研單位提供這類計算服務(wù),積累了一些經(jīng)驗,分享如下: 1.構(gòu)象搜索時必須的,一般閾值設(shè)為3.0即可。 2.必須結(jié)合NOESY挑選合適的構(gòu)象,不然計算結(jié)果跟實驗結(jié)果可能不吻合。 3.優(yōu)化時用常規(guī)基組如6-31G*就可以滿足。 4.計算激發(fā)態(tài)時,TD-B3LYP,真空條件多很多體系都能得到比較好結(jié)果,有個別體系,需要嘗試不同的方法,比如CAM-B3LYP,或者加上溶劑模型。 5.有些體系不管怎樣計算,都很難吻合的很好,這時候可以適當(dāng)提高能量閾值,比如設(shè)為5.0kcal/mol。 最后,歡迎感興趣的同行交流。Thanks a lot. |
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