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tq0ax1r新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
質(zhì)粒能表達(dá)MBP融合蛋白,不能表達(dá)目標(biāo)蛋白,向大神求解! 已有4人參與
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最近新構(gòu)建了一個(gè)新的質(zhì)粒,本人在這方面經(jīng)驗(yàn)不足,插入序列就是網(wǎng)上搜到的wide type序列,沒(méi)有做任何改變,是一個(gè)人源蛋白。原質(zhì)粒是PET系列帶MBP融合蛋白,在Rosetta大腸桿菌里表達(dá),沒(méi)有插入序列的空質(zhì)粒能大量表達(dá)MBP,但是把序列插入在MBP后SDSPAGE上沒(méi)有看到表達(dá)蛋白條帶。請(qǐng)問(wèn): 1. 想過(guò)換宿主菌,但是既然同樣的質(zhì)粒在這里能表達(dá)MBP,不能表達(dá)MBP+新蛋白,是否不是宿主菌的原因? 2. 試過(guò)20度,25度,OD = 0.7,0.8,0.9誘導(dǎo),沒(méi)有區(qū)別 3. 想嘗試換培養(yǎng)基,目前我只知道LB和M9,除此以外大家還能告知一些其它可以嘗試的培養(yǎng)基嗎? 4. 想過(guò)是否是因?yàn)槲矣玫脑蛐蛄,沒(méi)有做密碼子優(yōu)化,網(wǎng)上可以做codon optimization,打算嘗試一下,重新合成然后再插入這個(gè)質(zhì)粒,大家覺(jué)得會(huì)有效果嗎?P.S. rosetta本身就有表達(dá)稀有密碼子的優(yōu)勢(shì),所以我一開(kāi)始沒(méi)有在意這點(diǎn),到現(xiàn)在也不知道到底是不是密碼子沒(méi)優(yōu)化的原因。 5. 有人提議直接換質(zhì)粒,我對(duì)不同質(zhì)粒了解甚少,大家有什么推薦? 讀碼框都確認(rèn)過(guò),測(cè)序也是對(duì)的,這些應(yīng)該不是問(wèn)題,當(dāng)然老板也建議重新?lián)Q家公司再測(cè)一次序列。 請(qǐng)有經(jīng)驗(yàn)的大神賜教,感激不盡! |
至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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質(zhì)粒測(cè)序過(guò)嗎?確定克隆成功了?感覺(jué)很有可能是克隆的問(wèn)題,建議檢查引物重做pcr。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
金蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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