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Abbkine亞科因新蟲 (初入文壇)
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細(xì)胞凋亡DNA Ladder抽提試劑盒(離心柱式)實(shí)驗(yàn)操作原理
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原理 細(xì)胞在發(fā)生凋亡時(shí),核酸內(nèi)切酶激活,這些內(nèi)切酶會(huì)切斷核小體間的基因組DNA。細(xì)胞凋亡時(shí)抽提DNA進(jìn)行電泳檢測,可以發(fā)現(xiàn)180-200 bp或其整倍數(shù)的DNA Ladder。DNA Ladder是細(xì)胞凋亡的一個(gè)重要指標(biāo),通常觀察到DNA ladder,就可以判定細(xì)胞發(fā)生了凋亡。細(xì)胞凋亡DNA Ladder抽提試劑盒(離心柱式)通過DNA純化柱方式抽提DNA Ladder,比用傳統(tǒng)的酚氯仿抽提酒精沉淀方法更加便捷,小片段DNA不容易損失,可以非常有效地抽提最小片斷為180-200bp的DNA Ladder,同時(shí)又可以抽提到50 kb以上的基因組DNA。 自備耗材 ·可調(diào)節(jié)式移液槍及槍頭、離心管 ·離心機(jī)、渦旋振蕩器 ·水浴鍋、凝膠電泳儀 ·無水乙醇、PBS ·瓊脂糖、TAE、Loading Buffer、DNA Marker、EB 試劑準(zhǔn)備 Lysis Buffer A:即用型;室溫保存。 Lysis Buffer B:即用型;室溫保存。 Wash Buffer A:第一次使用前50 T添加9 mL無水乙醇,100 T添加18 mL無水乙醇,混勻并做好標(biāo)記;室溫保存。 Wash Buffer B:第一次使用前50 T添加32 mL無水乙醇,100 T添加64 mL無水乙醇,混勻并做好標(biāo)記;室溫保存。 Elution Buffer:即用型;室溫保存。 RNase A:即用型;-20℃保存。 Proteinase K:即用型;-20℃保存。 實(shí)驗(yàn)步驟 注意:需使用56℃或70℃水浴,請(qǐng)?zhí)崆白骱脺?zhǔn)備。 A.細(xì)胞樣本 1.收集約1×106個(gè)細(xì)胞,加入200 μL PBS,輕柔混勻,使細(xì)胞重懸于PBS中。 注意:如果使用凍存的細(xì)胞沉淀,先把細(xì)胞沉淀解凍,并輕輕彈散,然后再加入PBS重懸細(xì)胞。 2.加入2 μL RNase A,輕柔渦旋混勻,室溫放置3-5 min。 3.加入10 μL Proteinase K,輕柔渦旋混勻。 4.加入200 μL Lysis Buffer B,輕柔渦旋混勻,70℃孵育10 min。 注意:加入 Lysis Buffer B后必須立即渦旋混勻。不可把Proteinase K直接和Lysis Buffer B混合。 5.加入200 μL無水乙醇,輕柔渦旋混勻。 注意:加入乙醇后可能產(chǎn)生白色沉淀,屬正,F(xiàn)象。 6.把步驟5中的混合物(包括可能產(chǎn)生的沉淀)加入到Spin Column。12,000 rpm離心1 min,倒棄Collection Tube內(nèi)液體。 注意:進(jìn)行本步驟前需將Spin Column置于Collection Tube上。倒棄廢液后回收Collection Tube。必須把沉淀全部轉(zhuǎn)移到Spin Column內(nèi),否則會(huì)嚴(yán)重影響抽提效果。 7.加入0.5 mL Wash Buffer A(使用前先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1 min,倒棄Collection Tube內(nèi)液體。 8.加入0.6 mL Wash Buffer B(使用前先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1 min,倒棄Collection Tube內(nèi)液體。 9.12,000 rpm離心2 min,去除殘留的乙醇。 10.將Spin Column置于一新的1.5 mL離心管上,開蓋室溫干燥3-5 min,加入50-100 μL Elution Buffer。室溫放置 1-3 min。12,000 rpm離心1-2 min。所得液體即為純化得到的總DNA。 注意:為提高DNA提取量,可以將Elution Buffer預(yù)熱至56℃再洗脫,也可將第一次洗脫所得溶液重新加入Spin Column進(jìn)行洗脫。 11.取部分抽提得到的DNA,1%瓊脂糖凝膠電泳分析。 注意:如果細(xì)胞發(fā)生凋亡,即可觀察到典型的 DNA Ladder。電泳時(shí)一定要注意換用新鮮配制的電泳液,DNA凝膠也要用新鮮配制的電泳液配制并新鮮配制后使用。電泳時(shí)為獲取最佳的電泳效果使Ladder充分分開,電泳速度宜適當(dāng)慢一些,凝膠宜適當(dāng)長一些,而加樣孔宜更加扁平一些。選取適當(dāng)較薄的梳齒,往往會(huì)獲得更好的Ladder電泳效果。 B.動(dòng)物組織樣本 注意:與培養(yǎng)細(xì)胞相比,動(dòng)物組織樣本凋亡細(xì)胞出現(xiàn)的部位不定、規(guī)律性差,取樣部位及取樣量的不同,均會(huì)顯著影響最終DNA Ladder的提取效果,建議有豐富經(jīng)驗(yàn)的用戶使用本試劑盒提取組織凋亡DNA Ladder。 1.稱取不超過25 mg的組織(脾臟不超過10 mg),剪切成盡可能小的碎片,加入190 μL Lysis Buffer A。 注意:請(qǐng)勿使用過多的樣品,過多的樣品會(huì)導(dǎo)致抽提效果下降。較小的組織碎片會(huì)使裂解速度加快,裂解效果提高。新鮮或凍存的組織均可。 2.加入10 μL Proteinase K,輕柔渦旋混勻,56℃孵育直至完全裂解。 注意:在孵育期間可以偶爾取出樣品Vortex以加快裂解速度。裂解的時(shí)間因組織不同而有所不同,通?稍1-3 h內(nèi)完成。為方便起見,可以直接裂解過夜,裂解過夜對(duì)抽提效果無任何負(fù)面影響。組織完全裂解后可以呈粘稠狀,但不應(yīng)該呈可把Spin Column堵住的凝膠狀。如果消化過夜仍呈凝膠狀,說明樣品用量過多,作為補(bǔ)救措施,可以把整個(gè)反應(yīng)體系放大一倍。也可組織樣本經(jīng)液氮研磨成面粉狀,縮短裂解時(shí)間。 3.加入2 μL RNase A,輕柔渦旋混勻,室溫放置3-5 min。 4.渦旋混勻15 s,加入200 μL Lysis Buffer B,渦旋混勻,70℃孵育10 min。 注意:加入Lysis Buffer B后需立即渦旋混勻。加入Lysis Buffer B后可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,但大多數(shù)情況在70℃孵育后會(huì)溶解。即使70℃孵育后仍有白色沉淀也不會(huì)干擾后續(xù)實(shí)驗(yàn)。有些組織例如肺、脾,在加入樣品裂解液B后可能會(huì)形成凝膠狀物,此時(shí)需劇烈晃動(dòng)或渦旋樣品,以盡量破壞凝膠狀物。 5.后續(xù)步驟同A.5-A.11細(xì)胞樣本的步驟。 注意事項(xiàng) 1.溫度較低時(shí)Lysis Buffer A和Lysis Buffer B中可能會(huì)有沉淀產(chǎn)生,屬正常現(xiàn)象。如有沉淀,56℃水浴孵育溶解沉淀,混勻后使用。 2.本試劑盒所有操作均在室溫進(jìn)行,所有離心也均在室溫進(jìn)行。 3.Collection Tube在一次抽提中需多次使用,切勿中途丟棄。 |
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