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目的基因片段總是裝載不上pMD18-T載體上,求助。。 已有1人參與
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一、用高保真酶、設計的引物對細菌DNA進行PCR擴增(50μL體系共三管),電泳后發(fā)現(xiàn)條帶單一且無雜帶 二、PCR產物純化 三、將膠回收的DNA片段加A尾: 1.膠回收提取液與Taq酶預混物1:1混合,各為25μL(共50μL) 2.72℃退火30min 3.PCR產物純化【純化過程中的第二步:2.估計PCR反應液或酶切反應液的體積,向其中加入等倍體積溶液PC(此步加入30μLPC,實際上上一步PCR反應液為50μL,但誤以為是30μL,所以加了30μL溶液PC與50μLPCR反應液混合均勻后就加入吸附柱中了,加完后發(fā)現(xiàn)加錯了,又向吸附住中補加了20uL)】 四、將pMD18-T載體與已純化的目的片段相連接: 1.1μLpMD18-T載體、5μL連接緩沖液SolutionⅠ、4μL已純化的PCR產物加入到一個新的PCR管中混勻 2.將其放入金屬浴連接槽中16℃恒溫過夜,本次連接時間共計17h左右 3.將樣品取出冰箱4℃保存。 五、將質粒轉入感受態(tài)細胞(CaCl2轉化法): 1.從-80℃冰箱中取出一管制備好的感受態(tài)細胞Top10(100μL),立即置于冰水混合物上,將10μL制備好的質粒加入感受態(tài)細胞中,輕輕吹打混勻,將混合物置于冰水混合物中靜置30min 2.將其放在42℃水浴鍋中熱激90s 3.將其取出再置于冰水混合物中5min,然后加入1mL新鮮LB液體培養(yǎng)基中,37℃,200rpm,培養(yǎng)1h。 六、涂平板及培養(yǎng): 1.制備兩個氨芐抗性平板:向60mLLB固體培養(yǎng)基(不燙手即可)中按照1:1000的比例加入60μL氨芐抗性(原液濃度100mg/mL),輕晃混勻,倒兩個平板,靜止凝固 2.先吸取100μL菌液均勻涂布在氨芐抗性平板上,剩余900μL菌液11000rpm離心1min,棄去800μL上清液,剩余100μL菌液重懸,均勻涂布在另一個氨芐抗性平板上;37℃過夜培養(yǎng),本次共計培養(yǎng)20h左右 七、挑菌落及培養(yǎng):挑取平板上的單菌落(共七個)分別接種到新鮮LB液體培養(yǎng)基中,37℃,200rpm,過夜培養(yǎng),由于操作失誤,導致前20h無振蕩培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)菌液渾濁度較低,又200rpm振蕩培養(yǎng)了4哈,共計24h 八、菌液PCR:用Taq酶、設計的引物、菌液分別作模版進行PCR九、電泳:結果七種陽性菌液都顯示有目的條帶 九、任意選取一瓶菌液吸取1.5mL提取質粒:質粒小提試劑盒 十、雙酶切驗證目的基因片段是否成功裝載上pMD18-T載體上: 1.(20uL體系)質粒10u、10xbuffer2u、Pst1 0.5u、Sac1 0.5u、ddH2O7u混合;38攝氏度恒溫培養(yǎng)箱溫育1h10min; 2.電泳:結果顯示無條帶 這是我用這種方法(試劑的用量、步驟都一樣)將目的片段裝載到T載體的第三次實驗了,前兩次用的引物不是設計的引物,而是從文獻中篩選到的引物,目的是想通過裝載T載體上,測序出目的片段兩端的未知序列,但通過測序結果都顯示空載,都沒有成功裝載了,后面通過全基因比對出了目的片段的兩端序列,即從全基因中找出了目的基因的完整序列,之后又通過軟件重新設計引物(可以擴增出完整目的片段),然后就做了上述步驟,只不過沒有測序,而是通過雙酶切檢驗是否成功裝載到T載體上,還是沒有裝載上。 拜托大佬請教一下幾個問題: 1.做了這三次實驗最后菌液PCR電泳后都顯示有目的條帶,前兩次有一次還做了質粒PCR電泳后也顯示有條帶啊,但是就是進一步驗證測序顯示空載,包括這次雙酶切電電泳后顯示無條帶,我想知道這是哪里出問題了?電泳驗證都顯示有條帶,但最后進一步驗證還是空載,那電泳顯示有條帶是咋回事?難道電泳這么不靠譜嗎?難道以后我都要再測序或者雙酶切進一步驗證嗎? 2.哪些具體步驟可能導致我一直裝載不上T載體? 3.我該如何優(yōu)化實驗讓目的片段成功裝載到T載體上呢? 4.以上步驟所有用到的酶,我都是從冰箱里拿出來,也沒有放在冰上加,直接放在離心管架上加的,這會對最終實驗結果有影響嗎? |
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至尊木蟲 (職業(yè)作家)
資深木蟲
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1.一般情況下目的基因連接T載體很容易成功的;2.做菌液PCR,用擴增目的基因的引物擴增完,產物電泳檢測,挑選陽性菌液送sanger測序,一般沒問題;3.你的菌液PCR是假陽性,有可能是你沒連接上T載體,也有可能是你重組質粒轉化感受態(tài)細胞有問題; 發(fā)自小木蟲手機客戶端 |
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