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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 動植物 » 實驗技術 » 空間組學是什么？
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空間組學深耕人新蟲 (初入文壇)
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空間組學的發(fā)展 盤古一劃開天地，頂天立地幻化時空萬物。在物質(zhì)的相互作用中，生命開始孕育。有區(qū)室化類細胞結構的形成標志著細胞的起源，以往蕩漾在混沌之湯中的生物大分子被賦予更精準的職能。從個體集結到群體，從共性分化至個性，生物分子以獨特空間結構組合構成精巧的具備不同功能與形態(tài)的生命體，進一步互通有無，萬物交融，賦予生命絢爛多姿。 大多研究方法以組織或細胞或單分子為單位將各組分從研究對象中提取出來進行單因素研究。但個體功能機制的形成往往涉及多細胞（不同類型不同狀態(tài)的細胞）、多層面（基因、轉(zhuǎn)錄物、蛋白、代謝物、表觀修飾、環(huán)境等）的因素影響，最終我們要將各組分放回到它原本的位置中，以高保真的還原這些瞬時分子事件，分子空間標記技術將使這些攜帶體外索引標簽的生物大分子眼見為實。1969年放射性原位雜交技術首次被用于爪蟾卵母細胞的rRNA和DNA可視化，然而傳統(tǒng)的DNA、RNA FISH及免疫熒光的檢測通量受限于熒光基團的選擇。 如何將高通量測序獲得的信息與其特征空間位置關聯(lián)起來是近年來科研者們共同努力的方向，人類細胞圖譜計劃的提出使空間轉(zhuǎn)錄組成為炙手可熱的新型前沿技術。在1996年能與一代測序聯(lián)合使用的激光顯微切割(LCM）系統(tǒng)被報道，并且很快商品化。在1995年固相cDNA微陣列捕獲技術首次報道，而后這種技術以另一種形式被應用于當前空間轉(zhuǎn)錄組技術中，如空間轉(zhuǎn)錄組學（ST）、 10X Visium、Slide-seq及Stereo-seq。 空間組學哪家強 現(xiàn)行的空間轉(zhuǎn)錄組技術主要有3個研究方向,結合下一代測序的空間轉(zhuǎn)錄組、序列原位雜交的技術及原位測序技術，各類方法具有其優(yōu)缺點及組織適應性（圖1）。 圖1. 三種空間組學技術流派 （A）基于下一代測序方法的示意圖；（B）序列雜交方法示意圖；（C）原位測序方法示意圖。 上述詳述的空間轉(zhuǎn)錄組方法特點匯總?cè)缦卤硭荆?br /> 表1. 空間轉(zhuǎn)錄組方法對比 隨著超分辨顯微成像技術的發(fā)展各類以多輪序列成像來實現(xiàn)高通量單分子編碼的新型原位雜交技術興起，它包含smFISH、seqFISH、MERFISH、ISS等。空間組學技術彌補了單細胞測序技術缺乏空間位置信息的不足，實現(xiàn)了空間組織上高通量分子表達模式的原位可視化。 整明白了吧！ 那么問題又來了！ 枝上柳綿吹又少，科研燒發(fā)何時了？工作匯報師怒嚎，卷我額上三重毛！何解？空轉(zhuǎn)方法多又好，哪款合適性價比高？ 下回告訴你一個經(jīng)濟實惠，又能獲得大視場、單細胞分辨率的空間細胞圖譜的方法。值得期待哦！ |
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2樓2024-09-17 17:34:41
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