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空間組學(xué)深耕人新蟲 (初入文壇)
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空間組學(xué)是什么？ 已有1人參與
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空間組學(xué)的發(fā)展 盤古一劃開天地，頂天立地幻化時(shí)空萬(wàn)物。在物質(zhì)的相互作用中，生命開始孕育。有區(qū)室化類細(xì)胞結(jié)構(gòu)的形成標(biāo)志著細(xì)胞的起源，以往蕩漾在混沌之湯中的生物大分子被賦予更精準(zhǔn)的職能。從個(gè)體集結(jié)到群體，從共性分化至個(gè)性，生物分子以獨(dú)特空間結(jié)構(gòu)組合構(gòu)成精巧的具備不同功能與形態(tài)的生命體，進(jìn)一步互通有無(wú)，萬(wàn)物交融，賦予生命絢爛多姿。 大多研究方法以組織或細(xì)胞或單分子為單位將各組分從研究對(duì)象中提取出來(lái)進(jìn)行單因素研究。但個(gè)體功能機(jī)制的形成往往涉及多細(xì)胞（不同類型不同狀態(tài)的細(xì)胞）、多層面（基因、轉(zhuǎn)錄物、蛋白、代謝物、表觀修飾、環(huán)境等）的因素影響，最終我們要將各組分放回到它原本的位置中，以高保真的還原這些瞬時(shí)分子事件，分子空間標(biāo)記技術(shù)將使這些攜帶體外索引標(biāo)簽的生物大分子眼見為實(shí)。1969年放射性原位雜交技術(shù)首次被用于爪蟾卵母細(xì)胞的rRNA和DNA可視化，然而傳統(tǒng)的DNA、RNA FISH及免疫熒光的檢測(cè)通量受限于熒光基團(tuán)的選擇。 如何將高通量測(cè)序獲得的信息與其特征空間位置關(guān)聯(lián)起來(lái)是近年來(lái)科研者們共同努力的方向，人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃的提出使空間轉(zhuǎn)錄組成為炙手可熱的新型前沿技術(shù)。在1996年能與一代測(cè)序聯(lián)合使用的激光顯微切割(LCM）系統(tǒng)被報(bào)道，并且很快商品化。在1995年固相cDNA微陣列捕獲技術(shù)首次報(bào)道，而后這種技術(shù)以另一種形式被應(yīng)用于當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)中，如空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（ST）、 10X Visium、Slide-seq及Stereo-seq。 空間組學(xué)哪家強(qiáng) 現(xiàn)行的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)主要有3個(gè)研究方向,結(jié)合下一代測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組、序列原位雜交的技術(shù)及原位測(cè)序技術(shù)，各類方法具有其優(yōu)缺點(diǎn)及組織適應(yīng)性（圖1）。 圖1. 三種空間組學(xué)技術(shù)流派 （A）基于下一代測(cè)序方法的示意圖；（B）序列雜交方法示意圖；（C）原位測(cè)序方法示意圖。 上述詳述的空間轉(zhuǎn)錄組方法特點(diǎn)匯總?cè)缦卤硭荆?br /> 表1. 空間轉(zhuǎn)錄組方法對(duì)比 隨著超分辨顯微成像技術(shù)的發(fā)展各類以多輪序列成像來(lái)實(shí)現(xiàn)高通量單分子編碼的新型原位雜交技術(shù)興起，它包含smFISH、seqFISH、MERFISH、ISS等�？臻g組學(xué)技術(shù)彌補(bǔ)了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)缺乏空間位置信息的不足，實(shí)現(xiàn)了空間組織上高通量分子表達(dá)模式的原位可視化。 整明白了吧！ 那么問(wèn)題又來(lái)了！ 枝上柳綿吹又少，科研燒發(fā)何時(shí)了？工作匯報(bào)師怒嚎，卷我額上三重毛！何解？空轉(zhuǎn)方法多又好，哪款合適性價(jià)比高？ 下回告訴你一個(gè)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠，又能獲得大視場(chǎng)、單細(xì)胞分辨率的空間細(xì)胞圖譜的方法。值得期待哦！ |
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yubeihong
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2樓2024-09-17 17:34:41
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