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免疫共沉淀
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免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種利用抗原與抗體之間的專一性為基礎,廣泛應用于研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典研究方法。 原理 如果細胞內(nèi)兩蛋白(A、B)有直接或間接的相互作用時,那么在溫和的裂解條件下獲得的蛋白樣品中加入 A 蛋白的抗體將A蛋白沉淀下來,在細胞內(nèi)與A蛋白直接相互作用的B蛋白或與其間接相互作用的C蛋白能一起被沉淀下來。使用western blot檢測沉淀中是否存在B或C蛋白來確定B或C蛋白與A蛋白的相互作用。 用途 1、檢測A、B蛋白在體內(nèi)是否相互結合 2、分離與A蛋白相互作用的蛋白復合物 優(yōu)缺點 優(yōu)點: (1)相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的,處于天然狀態(tài); (2)蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進行的,可以避免人為的影響; (3)可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復合物。 缺點: (1)可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用; (2)兩種蛋白質(zhì)的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋梁作用; (3)必須在實驗前預測目的蛋白是什么,以選擇最后檢測的抗體,所以,若預測不正確,實驗就得不到結果,方法本身具有冒險性。 步驟 一、細胞的鋪板與轉染 1、提前一晚將293T細胞鋪板至6 cm皿中,鋪板量以達到相應的轉染試劑要求為準; 2、用各實驗室相應的轉染試劑將以下質(zhì)粒組合轉染兩皿細胞:flag 空載+HA-B;flag-A+HA-B;每質(zhì)粒2微克。 二、免疫沉淀 1、轉染24小時后,收獲細胞,每皿加入500 μL裂解液,收集細胞至1.5 mL EP 管中,在冰上超聲破碎細胞; 2、超聲好后,4℃,12,000 g,離心30分鐘,取400 μL上清液用于免疫沉淀,80 μL上清用作總蛋白并加入等體積的2Ⅹ loading buffer; 3、將400 μL上清加入用裂解液清洗了3遍的beads中,加入0.3-0.5 μg flag抗體,4℃孵育 3-4 小時; 4、4℃,2,000 rpm,離心3分鐘,去除未結合的液體,留下beads沉淀,用預冷的蛋白裂解液清洗沉淀3次,每次5分鐘; 4、最后一次去除清洗液,往沉淀中加入60 μL 2Ⅹ loading buffer,和總蛋白一起在沸水中煮沸 15 分鐘。 三、Western Blot 檢測 通過 SDS-PAGE 分離樣品,利用全蛋白樣品作為對照,檢測flag-A和HA-B蛋白是否發(fā)生結合。 注意事項 1、對于內(nèi)源的Co-IP檢測應該用10cm皿來培養(yǎng)目的細胞,并維持較好的生長狀態(tài); 2、如果該實驗用于新蛋白的鑒定,應注意抗體重鏈和輕鏈的影響; 3、該實驗不能確定蛋白之間的相互作用是直接還是間接的。 |
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