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免疫共沉淀
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免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種利用抗原與抗體之間的專一性為基礎(chǔ),廣泛應(yīng)用于研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典研究方法。 原理 如果細(xì)胞內(nèi)兩蛋白(A、B)有直接或間接的相互作用時(shí),那么在溫和的裂解條件下獲得的蛋白樣品中加入 A 蛋白的抗體將A蛋白沉淀下來(lái),在細(xì)胞內(nèi)與A蛋白直接相互作用的B蛋白或與其間接相互作用的C蛋白能一起被沉淀下來(lái)。使用western blot檢測(cè)沉淀中是否存在B或C蛋白來(lái)確定B或C蛋白與A蛋白的相互作用。 用途 1、檢測(cè)A、B蛋白在體內(nèi)是否相互結(jié)合 2、分離與A蛋白相互作用的蛋白復(fù)合物 優(yōu)缺點(diǎn) 優(yōu)點(diǎn): (1)相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的,處于天然狀態(tài); (2)蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,可以避免人為的影響; (3)可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物。 缺點(diǎn): (1)可能檢測(cè)不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用; (2)兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,而可能有第三者在中間起橋梁作用; (3)必須在實(shí)驗(yàn)前預(yù)測(cè)目的蛋白是什么,以選擇最后檢測(cè)的抗體,所以,若預(yù)測(cè)不正確,實(shí)驗(yàn)就得不到結(jié)果,方法本身具有冒險(xiǎn)性。 步驟 一、細(xì)胞的鋪板與轉(zhuǎn)染 1、提前一晚將293T細(xì)胞鋪板至6 cm皿中,鋪板量以達(dá)到相應(yīng)的轉(zhuǎn)染試劑要求為準(zhǔn); 2、用各實(shí)驗(yàn)室相應(yīng)的轉(zhuǎn)染試劑將以下質(zhì)粒組合轉(zhuǎn)染兩皿細(xì)胞:flag 空載+HA-B;flag-A+HA-B;每質(zhì)粒2微克。 二、免疫沉淀 1、轉(zhuǎn)染24小時(shí)后,收獲細(xì)胞,每皿加入500 μL裂解液,收集細(xì)胞至1.5 mL EP 管中,在冰上超聲破碎細(xì)胞; 2、超聲好后,4℃,12,000 g,離心30分鐘,取400 μL上清液用于免疫沉淀,80 μL上清用作總蛋白并加入等體積的2Ⅹ loading buffer; 3、將400 μL上清加入用裂解液清洗了3遍的beads中,加入0.3-0.5 μg flag抗體,4℃孵育 3-4 小時(shí); 4、4℃,2,000 rpm,離心3分鐘,去除未結(jié)合的液體,留下beads沉淀,用預(yù)冷的蛋白裂解液清洗沉淀3次,每次5分鐘; 4、最后一次去除清洗液,往沉淀中加入60 μL 2Ⅹ loading buffer,和總蛋白一起在沸水中煮沸 15 分鐘。 三、Western Blot 檢測(cè) 通過 SDS-PAGE 分離樣品,利用全蛋白樣品作為對(duì)照,檢測(cè)flag-A和HA-B蛋白是否發(fā)生結(jié)合。 注意事項(xiàng) 1、對(duì)于內(nèi)源的Co-IP檢測(cè)應(yīng)該用10cm皿來(lái)培養(yǎng)目的細(xì)胞,并維持較好的生長(zhǎng)狀態(tài); 2、如果該實(shí)驗(yàn)用于新蛋白的鑒定,應(yīng)注意抗體重鏈和輕鏈的影響; 3、該實(shí)驗(yàn)不能確定蛋白之間的相互作用是直接還是間接的。 |
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