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WB常見問題分析
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WB常見問題分析 蛋白質(zhì)免疫印跡(Western Blot,WB 是很常規(guī)的生物學(xué)實驗,是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,然后利用抗體進(jìn)行檢測的方法。與Southern或Northern雜交方法類似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過底物顯色或放射自顯影以檢測電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。該技術(shù)也廣泛應(yīng)用于檢測蛋白水平的表達(dá)。不過真正在實驗室里做實驗的小伙伴恐怕都遇到過各種實驗結(jié)果不完美的狀況,總結(jié)WB實驗中可能會遇到的問題,分析可能的原因及對應(yīng)的解決方案。下面我們列舉一些常見問題一個個分析。1.膠片是一片空白,是怎么回事? 答:如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。 1)二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光; 2)ECL底物中H2O2不穩(wěn)定,失活; 3) ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置; 4)一抗選擇不當(dāng); 5) 二抗失活。 2.蛋白條帶位置(大。┎粚φφ? 答:可能的原因有: 1)膠濃度不對,不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差,可以調(diào)整濃度 2)抗體孵育不充分,建議增加抗體濃度,延長孵育時間 3)酶失活,建議直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物 4)目的蛋白存在翻譯后修飾或剪切體,建議查詢相關(guān)文獻(xiàn)確定 5)標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低,建議設(shè)置陽性對照比對結(jié)果,增加標(biāo)本上樣量 3.有很多雜帶咋回事? 答:可能的原因有: 1)目的蛋白有多個修飾位點,本身可以呈現(xiàn)多條帶,建議查閱文獻(xiàn)或進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白實際大小 2) 樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解,建議加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時在冰上操作 3)雜蛋白多,建議處理目的蛋白 4)抗體特異性不強,建議使用特異性強的抗體 5)抗體孵育時間過久,建議減少抗體孵育時間 6)二抗與抗原有交叉反應(yīng),建議選擇合適的封閉物 7)二聚體或多聚體存在,建議增加蛋白質(zhì)變性過程及強度 8)底物顯色與曝光時間過長,建議縮短顯色及曝光的時間 4.背景有黑色斑點或有不均勻的白色斑點以及暗背景上白色帶 答:可能的原因有: 1)抗體與封閉試劑反應(yīng),建議使用前過濾封閉試劑 2)HRP含量過高,建議降低酶聯(lián)二抗的濃度 3)HRP偶聯(lián)二抗中有聚集體,建議過濾二抗試劑,去除聚集體 4)抗體分布不均勻,建議孵育抗體時使用搖床 5.為什么我的細(xì)胞提取液中沒有檢測到目的蛋白? 答:可能的原因有: 1)細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì),換一種細(xì)胞; 2)抗體不能識別目標(biāo)蛋白,多看看說明,是否有問題; 3)可能是沒有保持低溫操作,樣品保存不當(dāng),樣品放置時間過長; 4)細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被酶降解掉了,可加入蛋白酶抑制劑,抑制蛋白酶活性。 6.我的目的帶很弱,如何加強? 答:1)可以加大抗原上樣量,這是最主要的; 2)也可以將一抗稀釋比例降低; 3)還可以延長曝光時間。 7.我做的蛋白質(zhì)分子量很。10KD),請問怎么做WB? 答:1)可選擇孔徑0.22um的PVDF膜或者NC膜,轉(zhuǎn)膜時間縮短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE體系; 2)也可以選擇PSQ 膜,同時縮短轉(zhuǎn)移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。 8.WB中抗體的可以重復(fù)應(yīng)用嗎? 答:抗體工作溶液一般不主張儲存反復(fù)使用,但是如抗體比較珍貴,可反復(fù)使用2-3次。稀釋后應(yīng)在2-3天內(nèi)使用,4度保存,避免反復(fù)凍融。 |
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