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科研小dai新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
大佬,求助熒光光譜形狀意義 已有1人參與
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有的熒光光譜呈現(xiàn)好幾個(gè)山峰狀,那峰頂和峰谷代表什么? 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
木蟲(chóng)之王 (文壇精英)
上善若水,利萬(wàn)物而不爭(zhēng)
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較為理想的熔解曲線是單峰曲線,如出現(xiàn)多峰有以下原因: 1)非特異性擴(kuò)增:主要原因?yàn)橐锾禺愋圆缓、Tm值較低或模板質(zhì)量不高,可以根據(jù)設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)新引物或者通過(guò)梯度 PCR 對(duì)引物退火溫度(Tm值)進(jìn)行優(yōu)化,上調(diào)Tm值,選購(gòu)質(zhì)量較好的離心柱法核酸提取試劑,提高核酸提取質(zhì)量,等等。 2)引物二聚體 可通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳確認(rèn)引物二聚體。引物二聚體在凝膠的底部形成擴(kuò)散條帶,通常位于100 bp以下。引物二聚體在熔解曲線內(nèi)峰值一般位于75℃左右,如該峰顯著請(qǐng)按照以下方面進(jìn)行優(yōu)化: A.優(yōu)化擴(kuò)增條件,如提高退火溫度,可利用梯度PCR,摸索最佳的Tm值。通常兩步循環(huán)(由 95℃變性步驟直接進(jìn)入 60℃退火和延伸步驟) 有利于強(qiáng)效擴(kuò)增,因此引物設(shè)計(jì)時(shí)設(shè)定的成功退火溫度為 60℃。 B.引物濃度太高,適當(dāng)降低引物濃度。通常引物的Tm低于目的基因,熔解曲線上峰值在目的基因峰的左邊。大多數(shù)情況下,每條引物的理想最終濃度為200 nM,但如有需要,可將濃度降至60nM。 C.cDNA模板帶有基因組DNA污染:重新制備cDNA模板。在RNA提取完成后加入DNase對(duì)RNA進(jìn)行處理,然后逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。 如果排除以上原因還是出現(xiàn)熔解曲線多峰的情況,就要考慮及時(shí)更換試劑盒,避免耽誤實(shí)驗(yàn)進(jìn)度。 |
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[基金申請(qǐng)]
剛錄用,沒(méi)有期刊號(hào),但是在線可看的論文可以放為代表作嗎
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arang1 2026-03-01 | 3/150 |
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