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計算化學小白關于使用gaussian和MS做吸附的一些基礎問題想請教，請大家?guī)蛶兔�，感謝
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大家好，我是計算化學小白，目前研二，課題開始較晚，有一些關于Gaussian和MS的基礎問題想請教大家，十分感謝！因為涉及到MS軟件，請版主審核時給小白一個機會，非常感謝！ 我的方向是多孔材料（MOF、COF）吸附VOCs（苯、乙苯、苯乙烯等），目前我的想法是，通過gaussian計算吸附劑和吸附質(zhì)的各個原子的電荷，然后在MS里通過設置力場和計算得到的電荷做吸附。我的問題是： （1）若在gaussian中計算電荷，吸附劑和吸附質(zhì)的模型是在GaussView中構建，還是在MS中構建然后提交到gaussian中計算比較合理？如果是在gaussview中構建的，如何保證在MS中做吸附時構建的模型和gaussview中構建的是一樣的？ （2）接（1），提交到gaussian中去計算電荷的結構必須是優(yōu)化之后與實際分子結構信息（鍵長、鍵角、二面角等）相差不大，還是只要保證結構中原子的數(shù)量和種類、原子之間鍵的數(shù)量和類型相符合就可以？ （3）通過學習sob老師的博文（https://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）和原子電荷計算方法（https://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）這篇文獻，我的吸附劑結構（MOF、COF）設置為剛體，MK電荷和RESP電荷應該選擇哪個更準確？對于吸附質(zhì)（苯、乙苯、苯乙烯等）又該選擇哪個電荷更準確？ （4）關于力場的選擇：通過查閱文獻，MOF因含有過渡金屬，通常采用UFF力場，COF采用Dreiding力場，吸附質(zhì)設置為與吸附劑相同的力場。MK電荷或者RESP電荷適用于這兩種力場嗎？ （5）假設我在MS中構建好了一個結構，想使用gaussian進行幾何優(yōu)化，優(yōu)化之后再導入到MS進行后續(xù)吸附，如何實現(xiàn)兩款軟件的互相導入導出？ 請各位大佬不吝賜教，謝謝大家！ |
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請問還有沒有用Latex寫文章的小伙伴們？
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2樓2023-07-04 16:32:49
晴空超越
新蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 表面、形態(tài)與形貌分析
3樓2023-09-20 13:40:05
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