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寒月孤舟鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于使用Xcalibur處理高分辨質(zhì)譜數(shù)據(jù)的問(wèn)題，求大佬解答，萬(wàn)分感謝
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| 各位大佬，最近我們組用艾草純露走了液質(zhì)，想看一下里面有哪些成分。用的是UPLC-Q Exactive Orbitrap MS/MS。三批純露來(lái)自同一廠家，生產(chǎn)日期不同，每批取三個(gè)樣進(jìn)儀器（取了三次，不是同一個(gè)樣進(jìn)三針），QC是9個(gè)樣品的混合物。樣品是Full MS，QC是dd-MS2。目前在用Xcalibur處理質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)�，F(xiàn)在的問(wèn)題是，通過(guò)對(duì)二級(jí)確定了QC里面有5種物質(zhì)，現(xiàn)在想知道這5種物質(zhì)分別屬于哪一批，于是根據(jù)QC確定的這5種物質(zhì)的tR和母離子m/z，在樣品里面提取這5種物質(zhì)的母離子，但是在樣品里只提取到了2種物質(zhì)的母離子。QC是三批純露的混合物，這三種物質(zhì)不可能每一批樣品都沒(méi)有吧？不然QC里怎么會(huì)出峰呢？是這3種物質(zhì)在樣品中含量太低了，儀器沒(méi)有檢測(cè)到，還是對(duì)二級(jí)出現(xiàn)了問(wèn)題，這3種物質(zhì)本來(lái)是不存在的？求大佬解答，萬(wàn)分感謝！ |
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寒月孤舟
鐵蟲 (初入文壇)
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謝謝您的回復(fù)，QC做了二級(jí)，是FTMS/dd-MS2，不知道是不是您說(shuō)的FMS-dd-MS2，樣品是Full MS Scan，沒(méi)有做二級(jí)。 通過(guò)用QC對(duì)一級(jí)確定 rt和分子式，再對(duì)二級(jí)確定結(jié)構(gòu)。然后從每個(gè)樣品里提取這些物質(zhì)的母離子，記錄峰面積。 現(xiàn)在QC里面對(duì)上了5種物質(zhì)，樣品中母離子峰的m/z與理論值誤差很�。▽�(duì)上小數(shù)點(diǎn)后兩位），同位素峰相對(duì)豐度也與理論值一致，二級(jí)的碎片離子也都能對(duì)上3個(gè)以上（對(duì)上小數(shù)點(diǎn)后三位），因此確定5種物質(zhì)在QC里是有的，但是在樣品中有3種物質(zhì)的母離子怎么也找不到，但明明QC里找到了這三種物質(zhì)的母離子，所以很奇怪。 請(qǐng)問(wèn)您遇到過(guò)這種情況嗎？ |
3樓2023-03-25 18:39:35
neurbio
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2樓2023-03-25 01:45:32
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