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| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者寒月孤舟將贈送您 30 個金幣 | ||
[求助]
關于使用Xcalibur處理高分辨質(zhì)譜數(shù)據(jù)的問題，求大佬解答，萬分感謝
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| 各位大佬，最近我們組用艾草純露走了液質(zhì)，想看一下里面有哪些成分。用的是UPLC-Q Exactive Orbitrap MS/MS。三批純露來自同一廠家，生產(chǎn)日期不同，每批取三個樣進儀器（取了三次，不是同一個樣進三針），QC是9個樣品的混合物。樣品是Full MS，QC是dd-MS2。目前在用Xcalibur處理質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)�，F(xiàn)在的問題是，通過對二級確定了QC里面有5種物質(zhì)，現(xiàn)在想知道這5種物質(zhì)分別屬于哪一批，于是根據(jù)QC確定的這5種物質(zhì)的tR和母離子m/z，在樣品里面提取這5種物質(zhì)的母離子，但是在樣品里只提取到了2種物質(zhì)的母離子。QC是三批純露的混合物，這三種物質(zhì)不可能每一批樣品都沒有吧？不然QC里怎么會出峰呢？是這3種物質(zhì)在樣品中含量太低了，儀器沒有檢測到，還是對二級出現(xiàn)了問題，這3種物質(zhì)本來是不存在的？求大佬解答，萬分感謝！ |
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2樓2023-03-25 01:45:32
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謝謝您的回復，QC做了二級，是FTMS/dd-MS2，不知道是不是您說的FMS-dd-MS2，樣品是Full MS Scan，沒有做二級。 通過用QC對一級確定 rt和分子式，再對二級確定結構。然后從每個樣品里提取這些物質(zhì)的母離子，記錄峰面積。 現(xiàn)在QC里面對上了5種物質(zhì)，樣品中母離子峰的m/z與理論值誤差很小（對上小數(shù)點后兩位），同位素峰相對豐度也與理論值一致，二級的碎片離子也都能對上3個以上（對上小數(shù)點后三位），因此確定5種物質(zhì)在QC里是有的，但是在樣品中有3種物質(zhì)的母離子怎么也找不到，但明明QC里找到了這三種物質(zhì)的母離子，所以很奇怪。 請問您遇到過這種情況嗎？ |
3樓2023-03-25 18:39:35
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