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星星奧特曼新蟲 (初入文壇)
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如何進(jìn)行油菜莖稈和葉片的ITS擴(kuò)增子自建庫?
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| 我使用試劑盒提取獲得了一批油菜莖稈和葉片的DNA,然后對(duì)他們進(jìn)行了16S擴(kuò)增子自建庫,目前送測結(jié)果良好。但I(xiàn)TS自建庫看卡了很久,主要原因有以下3點(diǎn):1,我使用的ITS1區(qū)ITS1F和ITS2,理論上能夠排除寄主的污染,但是沒有辦法排除我的油菜干擾,電泳檢測到的亮帶基本都是油菜序列;2,ITS很難擴(kuò)(目前已經(jīng)將一輪提高到了35個(gè)循環(huán)),但還是很多擴(kuò)不出來,猜測可能跟DNA樣品質(zhì)量有關(guān)?3,擴(kuò)出來也很難和油菜序列分開,無法進(jìn)行切膠回收進(jìn)行下一步。球球幫幫孩子!是引物問題還是樣品問題?文獻(xiàn)查閱和前輩咨詢都無果!而且我覺得沒可能直接把DNA送給公司去測,太難了!@天使托 |
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