| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1598 | 回復(fù): 9 | ||||
ZMQ68新蟲 (初入文壇)
|
[交流]
EMSA!!! 已有5人參與
|
|
最近做EMSA,EB染色后DNA片段一直看不到。想請教有經(jīng)驗的前輩一些問題。。。! 啟動子必須加探針標(biāo)記嗎???很無知無助無力了。。我現(xiàn)在只用了純化后的啟動子片段跟蛋白孵育后跑Native-PAGE,用考馬斯染蛋白有正確條帶,很正常。 但是用EB染色20min紫外照膠卻看不到DNA條帶,不知道什么原因。是不是DNA濃度低,有沒有做相關(guān)的實驗,能否告知一下您的實驗條件參考一下,,不勝感激。。。。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
專家顧問 (正式寫手)
![]() |
專家經(jīng)驗: +21 |
|
(1) 探針的濃度夠嗎? (單獨(dú)跑探針染色能染上嗎) (2) 探針的大。ㄊ欠裉,沒有進(jìn)入分離膠;是否太小,已經(jīng)跑出去了?) (3) 探針與蛋白結(jié)合的條件是否有利于結(jié)合(鎂離子是否必須,鹽離子濃度超過100mM了嗎? 緩沖液的pH值是多少?) (4) 在(3)的條件下,探針是否與蛋白結(jié)合(有實驗證據(jù)嗎) (5) 是否有可能存在探針被降解的可能? (6) 電泳過程是否大量產(chǎn)熱,是否導(dǎo)致蛋白變性,或者復(fù)合物解離? (7) 一步步做對照試驗吧,一個實驗不成功,很難說明哪(幾)個步驟有問題 good luck~ |

鐵蟲 (著名寫手)

新蟲 (初入文壇)
金蟲 (正式寫手)
新蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
|
謝謝回帖!! 1.用跑native-page膠制備的體系剩下的混合物跑了一次瓊脂糖凝膠電泳(DNA經(jīng)過比例稀釋),出現(xiàn)了很淺的一條帶。后續(xù)有重新進(jìn)行擴(kuò)增、產(chǎn)物純化鑒定,目前不確定不加標(biāo)記的探針我采取得濃度一系列操作下來染色是否可行。此外,在跑非變性膠做對照時,只有探針的膠孔染色也是看不見。 2.我采用的是連續(xù)體系,探針大小約250+bp或350bp,我單獨(dú)染蛋白位置大約在蛋白膠的1/3處,溴酚藍(lán)指示劑約在底部1/5處,按道理應(yīng)該沒有跑出去。電壓100V,約兩小時。 3.結(jié)合條件,參照文獻(xiàn)設(shè)定,實驗過程中沒有涉及到鎂離子,鹽濃度設(shè)置為50mM,緩沖液PH8。 4.參照文獻(xiàn)探針與蛋白應(yīng)該有結(jié)合,由于一直沒有染出DNA條帶,因此不確定是實驗方法問題,還是操作等問題。 5.DNA探針均為新制備,長時間可能會被降解,目前可能性較低。 6.電泳過程持續(xù)在4度下進(jìn)行,蛋白染色發(fā)現(xiàn)并沒有變性。7.非常感謝提出地注意事項!!!順便問一下DNA探針如果不標(biāo)記是否能做出來?標(biāo)記是必須的嗎? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
金蟲 (正式寫手)
|
根據(jù)我曾經(jīng)的經(jīng)驗,自由探針(未結(jié)合蛋白)是大多數(shù), 結(jié)合的只是少數(shù)。所以你能看到總的dna并不能代表能看到結(jié)合的條帶。以上是我的推測,歡迎一起討論。 我之前用同位素標(biāo)記的,沒有做過未標(biāo)記直接染色的。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
鐵蟲 (正式寫手)

| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿山東大學(xué)105500藥學(xué)專碩,總分302求調(diào)劑 +3 | 五維天空 2026-03-04 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 江西師范大學(xué)王昆-盧章輝課題組招化學(xué)方向碩士研究生兩名 +3 | 哈哈大俠 2026-02-28 | 3/150 |
|
|
[考研] 267調(diào)劑求助 +5 | 聰少OZ 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
[考研] 070300化學(xué) 280 一志愿太原理工 求調(diào)劑 +8 | 拾玖壹 2026-03-04 | 8/400 |
|
|
[考研] 一志愿武漢理工大學(xué)-085602-總分296分-求調(diào)劑 +7 | 紫川葡柚 2026-03-04 | 7/350 |
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +4 | xuyuan111 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 博斯特525 2026-03-04 | 7/350 |
|
|
[考研] 282求調(diào)劑 +5 | 2103240126 2026-03-02 | 8/400 |
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑 +3 | 將未有期 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
[考研] 331求調(diào)劑 +3 | zzZ&zZ 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
[考研]
材料325求調(diào)劑
30+5
|
mariusuki 2026-03-02 | 10/500 |
|
|
[考研] 266材料化工求調(diào)劑 +3 | 哇塞王帥 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
[考研] 一志愿中科大能動297求調(diào)劑,本科川大 +3 | 邵11 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
[考研]
材料工程專碩283求調(diào)劑
5+8
|
,!? 2026-03-02 | 10/500 |
|
|
[考研] 材料284求調(diào)劑,一志愿鄭州大學(xué)英一數(shù)二專碩 +15 | 想上岸的土撥鼠 2026-02-28 | 15/750 |
|
|
[考研] 306分材料調(diào)劑 +5 | chuanzhu川燭 2026-03-01 | 6/300 |
|
|
[考研] 一志愿山東大學(xué)材料與化工325求調(diào)劑 +5 | 半截的詩0927 2026-03-02 | 5/250 |
|
|
[基金申請] 成果系統(tǒng)訪問量大,請一小時后再嘗試。---NSFC啥時候好哦,已經(jīng)兩天這樣了 +4 | NSFC2026我來了 2026-02-28 | 4/200 |
|
|
[考博] 26申博 +4 | 想申博! 2026-02-26 | 6/300 |
|
|
[考研] 295復(fù)試調(diào)劑 +3 | 簡木ChuFront 2026-03-01 | 3/150 |
|