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學(xué)員pb6d6S銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
求助：請(qǐng)問(wèn)各位大牛在做藥物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)的時(shí)候?qū)嶋H上是怎么樣的設(shè)計(jì)思路？
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最近入職了一家創(chuàng)新藥公司，我所在的課題組，有時(shí)候是把設(shè)計(jì)好的新化合物結(jié)構(gòu)送到搞計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的部門(mén)，讓其模擬是否和受體適配，再去決定是否合成。有時(shí)候是拍腦子試一下加個(gè)甲基或者乙基之類(lèi)的基團(tuán)，合成出來(lái)試一下其生物活性。我想問(wèn)問(wèn)做藥物化學(xué)的同行(企業(yè)或者高校)，你們?cè)谧鏊幬锝Y(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)的時(shí)候?qū)嶋H上是怎么樣的設(shè)計(jì)思路的？剛做創(chuàng)新藥這行，比較迷惑，希望參考一下各位同行的經(jīng)驗(yàn)，能盡快入門(mén)，感謝！ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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zyqchem
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9樓2022-08-02 22:30:25
zyqchem
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我們一般是先確定靶點(diǎn)晶體結(jié)構(gòu)（如果已有報(bào)道），然后對(duì)陽(yáng)性對(duì)照藥進(jìn)行骨架躍遷，再通過(guò)分子模擬對(duì)接打分，尋找數(shù)值相對(duì)較高者，再利用已有的片段數(shù)據(jù)庫(kù)并結(jié)合構(gòu)效關(guān)系及等理論進(jìn)行優(yōu)化，再分析合成可行性，有選擇地合成。我們有專(zhuān)門(mén)的計(jì)算化學(xué)研究人員負(fù)責(zé)這些設(shè)計(jì)工作，合成人員輔助進(jìn)行 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
2樓2022-07-31 16:33:13
zyqchem
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另外，合成人員還要考察新設(shè)計(jì)的化合物是否有知識(shí)產(chǎn)權(quán)風(fēng)險(xiǎn)。我們是企業(yè)，目前主做me better類(lèi)創(chuàng)新藥，相對(duì)于me too類(lèi)的只是簡(jiǎn)單調(diào)整個(gè)別基團(tuán)的改造的設(shè)計(jì)，更容易做出自己的臨床優(yōu)勢(shì)，也符合目前國(guó)家政策的主要支持方向 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
3樓2022-07-31 16:47:50
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靶點(diǎn)晶體結(jié)構(gòu)可以在網(wǎng)上的PDB數(shù)據(jù)庫(kù)查，不止一個(gè)版本。配體與靶點(diǎn)蛋白對(duì)接的晶體結(jié)構(gòu)對(duì)于分子設(shè)計(jì)非常有幫助 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
4樓2022-07-31 16:51:18
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