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[求助]
求助：請問各位大牛在做藥物結構設計的時候實際上是怎么樣的設計思路？
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最近入職了一家創(chuàng)新藥公司，我所在的課題組，有時候是把設計好的新化合物結構送到搞計算機輔助藥物設計的部門，讓其模擬是否和受體適配，再去決定是否合成。有時候是拍腦子試一下加個甲基或者乙基之類的基團，合成出來試一下其生物活性。我想問問做藥物化學的同行(企業(yè)或者高校)，你們在做藥物結構設計的時候實際上是怎么樣的設計思路的？剛做創(chuàng)新藥這行，比較迷惑，希望參考一下各位同行的經(jīng)驗，能盡快入門，感謝！ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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zyqchem
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另外，合成人員還要考察新設計的化合物是否有知識產(chǎn)權風險。我們是企業(yè)，目前主做me better類創(chuàng)新藥，相對于me too類的只是簡單調整個別基團的改造的設計，更容易做出自己的臨床優(yōu)勢，也符合目前國家政策的主要支持方向 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2022-07-31 16:47:50
zyqchem
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我們一般是先確定靶點晶體結構（如果已有報道），然后對陽性對照藥進行骨架躍遷，再通過分子模擬對接打分，尋找數(shù)值相對較高者，再利用已有的片段數(shù)據(jù)庫并結合構效關系及等理論進行優(yōu)化，再分析合成可行性，有選擇地合成。我們有專門的計算化學研究人員負責這些設計工作，合成人員輔助進行 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2022-07-31 16:33:13
zyqchem
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靶點晶體結構可以在網(wǎng)上的PDB數(shù)據(jù)庫查，不止一個版本。配體與靶點蛋白對接的晶體結構對于分子設計非常有幫助 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2022-07-31 16:51:18
zyqchem
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5樓2022-07-31 18:12:18
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