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學(xué)員pb6d6S銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
求助:請問各位大牛在做藥物結(jié)構(gòu)設(shè)計的時候?qū)嶋H上是怎么樣的設(shè)計思路?
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最近入職了一家創(chuàng)新藥公司,我所在的課題組,有時候是把設(shè)計好的新化合物結(jié)構(gòu)送到搞計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的部門,讓其模擬是否和受體適配,再去決定是否合成。有時候是拍腦子試一下加個甲基或者乙基之類的基團(tuán),合成出來試一下其生物活性。我想問問做藥物化學(xué)的同行(企業(yè)或者高校),你們在做藥物結(jié)構(gòu)設(shè)計的時候?qū)嶋H上是怎么樣的設(shè)計思路的?剛做創(chuàng)新藥這行,比較迷惑,希望參考一下各位同行的經(jīng)驗,能盡快入門,感謝! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
銀蟲 (正式寫手)
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
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我們一般是先確定靶點(diǎn)晶體結(jié)構(gòu)(如果已有報道),然后對陽性對照藥進(jìn)行骨架躍遷,再通過分子模擬對接打分,尋找數(shù)值相對較高者,再利用已有的片段數(shù)據(jù)庫并結(jié)合構(gòu)效關(guān)系及等理論進(jìn)行優(yōu)化,再分析合成可行性,有選擇地合成。我們有專門的計算化學(xué)研究人員負(fù)責(zé)這些設(shè)計工作,合成人員輔助進(jìn)行 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
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另外,合成人員還要考察新設(shè)計的化合物是否有知識產(chǎn)權(quán)風(fēng)險。我們是企業(yè),目前主做me better類創(chuàng)新藥,相對于me too類的只是簡單調(diào)整個別基團(tuán)的改造的設(shè)計,更容易做出自己的臨床優(yōu)勢,也符合目前國家政策的主要支持方向 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
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靶點(diǎn)晶體結(jié)構(gòu)可以在網(wǎng)上的PDB數(shù)據(jù)庫查,不止一個版本。配體與靶點(diǎn)蛋白對接的晶體結(jié)構(gòu)對于分子設(shè)計非常有幫助 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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EST拒稿重投
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剛錄用,沒有期刊號,但是在線可看的論文可以放為代表作嗎
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