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| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者ymwaizc將贈送您 66 個金幣 | |||
ymwaizc金蟲 (正式寫手)
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[求助]
含B元素化合物的MD模擬求助
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合成了一個含有B元素的化合物，找做MD的同學做模擬，告訴我沒有B的力場參數，請教各位大佬，這種情況改如何解決呢？有沒有什么好的建議呢，謝謝了 |
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yongleli
木蟲 (正式寫手)
- 模擬EPI: 1
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- 專業(yè): 原子和分子物理
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網上有免費的generalized Charmm力場生成器，查找Swiss Charmm parameter，還有免費的OPLS力場生成器。Amber Tools里有GAFF力場生成器（需要去ambermd.org學習使用方法）但要注意，上述三種方法生成的力場參數中，電荷是不靠譜的，最好用RESP擬合，重新生成電荷。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
2樓2022-07-27 12:15:08
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