 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2958 | 回復: 2 | |||
冬瓜太郎1996新蟲 (初入文壇)
|
[交流]
在超算上安裝ATAT-VASP接口常見問題以及解決辦法 已有2人參與
|
|
1、.ezvasp.rc文件的配置方法：（標準例子） #!/bin/csh #enter name of vasp executable here （ ·這里的意思是填寫超算上安裝vasp的位置，最終要落到具體的版本上，vasp分三個版本：std、gamma和非線性版本，一般選擇std就可以； ·另外需要注意的是要選擇在VASP/安裝包路徑/bin文件夾下的，一定要選bin，不要選其他的； ·所有的路徑要帶引號） set VASPCMD="/opt/pub/softwares/VASP/5.4.4-gzbuild/bin/vasp_std" #enter the directories containing the pseudopotentials here set POTLDA="~/bin/USPP_LDA/USPP_LDA" set POTGGA="~/bin/USPP_GGA/USPP_PW91" set POTPAWLDA="~/bin/PAW_LDA/PAW_LDA" set POTPAWGGA="~/bin/PAW_GGA_pw91/PAW_PW91" set POTPAWPBE="~/bin/pbe54" 這里需要把五種贗勢庫的路徑都寫上去，其實在vasp.wrap文件中指定了pawpbe，也就是說ATAT做計算的時候其實默認用PBE54贗勢的，但是如果沒有把五種贗勢庫的位置都告訴軟件，軟件就會報錯。 2、一定要注意，將路徑添加到.ezvasp.rc以后，同時也要將vasp_std和五個贗勢庫的路徑也添加到環(huán)境變量（~/bin下的.bashrc文件)，如下： # .bashrc # Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi # User specific environment if ! [[ "$PATH" =~ "$HOME/.local/bin:$HOME/bin:" ]] then PATH="$HOME/.local/bin:$HOME/bin:$PATH" fi export PATH # Uncomment the following line if you don't like systemctl's auto-paging feature: # export SYSTEMD_PAGER= export PATH=:~/bin/ATAT/atat:$PATH export PATH=:~/bin/ATAT/ATAT_files:$PATH export PATH=:~/bin/ATAT/atat/bin:$PATH export PATH=:~/bin/pbe54:$PATH export PATH=:~/bin/USPP_LDA/USPP_LDA:$PATH export PATH=:~/bin/USPP_GGA/USPP_PW91:$PATH export PATH=:~/bin/PAW_LDA/PAW_LDA:$PATH export PATH=:~/bin/PAW_GGA_pw91/PAW_PW91:$PATH export PATH=:/opt/pub/softwares/VASP/5.4.4-gzbuild/build/std/vasp:$PATH 然后source .bashrc保存，否則不會生效 3、如果ezvasp和環(huán)境變量都配置好了，在runstruct_vasp之前，需要先module load VASP，否則仍然會出現以下報錯： cp: cannot stat 'OSZICAR': No such file or directory cp: cannot stat 'OUTCAR': No such file or directory cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory cp: cannot stat 'OSZICAR': No such file or directory cp: cannot stat 'OUTCAR': No such file or directory cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory cp: cannot stat 'DOSCAR': No such file or directory unable to open OSZICAR or OSZICAR.static 出現這個報錯的原因是打開vasp失敗，導致無法生成這些文件。前面1、2步是為了讓ATAT可以找到vasp在哪里，第三步是激活打開vasp，這三點注意了就可以成功！ |
回復此樓» 猜你喜歡
313求調劑
已經有4人回復
-
接收調劑
已經有27人回復
-
招調劑
已經有5人回復
-
材料學碩318求調劑
已經有19人回復
-
求調劑
已經有4人回復
-
A區(qū)一本交叉課題組，低分調劑，招收機械電子信息通信等交叉方向
已經有17人回復
-
一志愿山東大學105500藥學專碩，總分302求調劑
已經有5人回復
-
江西師范大學王昆-盧章輝課題組招化學方向碩士研究生兩名
已經有3人回復
-
沒上岸的看過來
已經有5人回復
-
290求調劑
已經有5人回復
2樓2022-04-26 14:29:36
風平不浪奚
新蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 34.5
- 帖子: 10
- 在線: 1.4小時
- 蟲號: 31022017
- 注冊: 2022-09-07
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結構
3樓2022-11-05 13:56:41
相關版塊跳轉
我要訂閱樓主 冬瓜太郎1996 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 301求調劑 +4 | 李LJR 2026-03-04 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿東北大學080500，英一數二343分求調劑 +5 | Seele_v5 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 328求調劑 +3 | vuzhdkfjkx 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求調劑 +3 | 邱gl 2026-03-05 | 6/300 |
|
|
[考研] 考研282分求調劑，接受跨專業(yè) +4 | 劉淄博 2026-03-04 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856材料求調劑 +17 | hyf hyf hyf 2026-02-28 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 材料復試調劑 +7 | 學材料的點 2026-03-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 264求調劑 +8 | 26調劑 2026-03-03 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 295求調劑 +6 | 等春來， 2026-03-04 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 本科太原理工采礦工程，求調劑 +3 | onlx 2026-03-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調劑 +4 | G212 2026-03-03 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 291求調劑 +3 | 咕嚕咕嚕123123 2026-03-02 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703 總分319求調劑 +4 | Xinyuu 2026-03-02 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 291求調劑 +4 | Afy123456 2026-03-03 | 7/350 |
|
|
|
[考博] 26申博 求博導 +3 | 愛讀書的小帥 2026-02-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 290求調劑 +9 | ErMiao1020 2026-03-02 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿中石油（華東）本科齊魯工業(yè)大學 +3 | 石能偉 2026-03-02 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工328求調劑 +3 | 。，。，。，。i 2026-03-02 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 295復試調劑 +3 | 簡木ChuFront 2026-03-01 | 3/150 |
|
|
|
[論文投稿]
Optics letters投稿被拒求助
 30+3
|
luckyry 2026-02-26 | 4/200 |
|