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木有昵稱我新蟲(chóng) (初入文壇)
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請(qǐng)問(wèn)用AutoDock Vina做金屬配合物的分子對(duì)接怎么做 已有1人參與
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各位大佬,請(qǐng)問(wèn): (1)AutoDock Vina 做金屬配合物分子對(duì)接怎么做 (2)我利用的是晶體的CIF文件進(jìn)行對(duì)接,金屬離子是Cu,怎么給金屬修正電荷呢? (3)如果是自己繪制金屬配合物的結(jié)構(gòu),該怎樣對(duì)金屬部分進(jìn)行操作呢? @smutao 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
新蟲(chóng) (初入文壇)

| 不知道您的問(wèn)題解決了沒(méi)有,最近我也在做這方面的東西,有一種解決方法是在生成的.pdbqt找到Cu,手動(dòng)添加電荷。可以參考這篇文章,是以格列衛(wèi)為例進(jìn)行分子對(duì)接的,我感覺(jué)很棒:https://www.nature.com/articles/nprot.2016.051 |

新蟲(chóng) (初入文壇)
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