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木有昵稱我新蟲(chóng) (初入文壇)
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請(qǐng)問(wèn)用AutoDock Vina做金屬配合物的分子對(duì)接怎么做 已有1人參與
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各位大佬，請(qǐng)問(wèn)： （1）AutoDock Vina 做金屬配合物分子對(duì)接怎么做 （2）我利用的是晶體的CIF文件進(jìn)行對(duì)接，金屬離子是Cu，怎么給金屬修正電荷呢？ （3）如果是自己繪制金屬配合物的結(jié)構(gòu)，該怎樣對(duì)金屬部分進(jìn)行操作呢？ @smutao 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
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新蟲(chóng) (初入文壇)
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3樓2025-09-22 22:49:43
【答案】應(yīng)助回帖
| 不知道您的問(wèn)題解決了沒(méi)有，最近我也在做這方面的東西，有一種解決方法是在生成的.pdbqt找到Cu，手動(dòng)添加電荷�？梢詤⒖歼@篇文章，是以格列衛(wèi)為例進(jìn)行分子對(duì)接的，我感覺(jué)很棒：https://www.nature.com/articles/nprot.2016.051 |
2樓2022-10-09 17:40:36
薛定諤軟件
新蟲(chóng) (初入文壇)
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4樓2025-10-18 00:20:46
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