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組學研究如何做好質(zhì)量控制?——摩賽恩
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組學研究一般具有樣本數(shù)量大,樣本收集周期長,個體差異大,樣本處理流程長、過程復雜,耗材種類多,檢測設備不穩(wěn)定性等特點。所以,質(zhì)量控制是組學研究的重要基礎。 1、樣本收集方案:研究方案中應明確樣本分組,每組樣本數(shù)量,樣本供體的納排標準,每個樣本的采集方法、體積/重量,現(xiàn)場前處理要求,儲存條件,樣本信息收集標準等內(nèi)容,避免產(chǎn)生錯誤采集、混肴、交叉錯配等問題。 2、耗材、儲存、運輸條件準備:離心管/離心機、現(xiàn)場前處理試劑、移液槍、封口膜、樣本標簽、干冰、保溫厚泡沫箱、-20℃/-80℃冰箱等均應按標準準備到位,最好是知名品牌,并經(jīng)過預試驗驗證,確保不會引入污染物;尋找有資質(zhì)的冷鏈運輸服務供應商提供樣本運輸服務,確保樣本不變質(zhì)。 3、樣本采集人員要求:需經(jīng)過系統(tǒng)培訓,熟悉樣本采集、現(xiàn)場前處理流程,操作規(guī)范、熟練,持證上崗。 4、樣本分組原則:通過篩查關鍵理化指標、疾病診斷分類/分級,盡可能選擇指標相近的樣本歸入同一組;若同時收集同一樣本供體的2種以上樣本(如血液、尿液),這2種樣本最好配對歸入同一樣本集,如發(fā)現(xiàn)集;從而盡可能降低同組、同集樣本間的個體差異。 5、樣本處理人員要求:需經(jīng)過系統(tǒng)培訓,熟悉樣本前處理流程,操作規(guī)范、熟練,持證上崗。 6、樣本質(zhì)量控制:確保樣本按規(guī)程一次解凍、快速取樣,避免反復凍融;通過外觀、理化指標、光譜檢測、SDS-PAGE凝膠分析等,剔除溶血、降解等不合格樣本;同組樣本隨機篩選其中的20%,等量收集后混合,處理方法與實際樣品一致,制備質(zhì)控樣品(QC)。 7、樣本處理:不同類型的樣本,如血液/尿液/組織等,需根據(jù)目標分子的性質(zhì)、含量、干擾雜質(zhì)等情況,設計、摸索、優(yōu)化最佳前處理方法,以最大限度除去雜質(zhì)、保留目標分子,或改變目標分子性質(zhì),適應檢測方法,或提升目標分子的檢測靈敏度;鑒于實驗過程復雜、步驟多,需高效、熟練、有序地按流程處理樣品,如移液時需避免上/下相交叉污染、避免氣泡,避免引入偶然誤差或污染物。 8、色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀的選擇、調(diào)試、校準:根據(jù)研究目的選擇合適的色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀;嚴格按照色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀的操作規(guī)程(SOP)進行設備參數(shù)的設置、調(diào)試和校準,確保設備運行準確、穩(wěn)定。 9、樣品檢測方法的建立與優(yōu)化:參考已有文獻和試驗積累,建立樣品分析檢測方法,包括色譜類型、流動性選擇,色譜梯度、流速、質(zhì)譜檢測參數(shù)設置等,并根據(jù)目標分子的檢測靈敏度、準確性、重現(xiàn)性、與雜質(zhì)的分離度等加以優(yōu)化和驗證,確定最佳樣品分析檢測方法。 10、數(shù)據(jù)采集:均勻插入空白對照、標準品對照、QC樣品,一般每6-8次插入一個空白對照、標準品對照和/或QC樣品,以避免殘留影響、幫助色譜峰校準;將不同批次收集的樣本與對照樣本根據(jù)分析序列交替進行數(shù)據(jù)采集,以避免批次效應;每個樣品中加入內(nèi)標,以幫助色譜峰校準和儀器穩(wěn)定性監(jiān)測;每個樣本重復檢測三次,取均值以避免偶然誤差。 11、數(shù)據(jù)質(zhì)量評估:采用誤差分析、聚類分析、主成分(PCA)分析、變異系數(shù)(CV)分析等方法,評估數(shù)據(jù)采集的質(zhì)量,若數(shù)據(jù)不合格,需重新采集、評估。 在組學研究過程中,如果嚴格按照上述方法進行過程質(zhì)量控制,則基本可以獲得較高質(zhì)量的組學檢測數(shù)據(jù),為后續(xù)數(shù)據(jù)處理、差異分析、特征分子鑒定、分類模型構(gòu)建和優(yōu)化奠定良好的基礎。 摩賽恩科技聚焦分子智能識別檢測技術(shù),開發(fā)自主知識產(chǎn)權(quán)核心算法,提供專業(yè)化組學和質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理、挖掘服務,滿足生物醫(yī)藥、食品等行業(yè)質(zhì)譜用戶個性化分子智能識別需求。在組學研究過程中,努力優(yōu)化組學研究過程中的質(zhì)量控制方法,才能為客戶呈現(xiàn)最好的組學研究結(jié)果! |
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