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摩賽恩科技新蟲(chóng) (初入文壇)
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組學(xué)研究如何做好質(zhì)量控制?——摩賽恩
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組學(xué)研究一般具有樣本數(shù)量大,樣本收集周期長(zhǎng),個(gè)體差異大,樣本處理流程長(zhǎng)、過(guò)程復(fù)雜,耗材種類(lèi)多,檢測(cè)設(shè)備不穩(wěn)定性等特點(diǎn)。所以,質(zhì)量控制是組學(xué)研究的重要基礎(chǔ)。 1、樣本收集方案:研究方案中應(yīng)明確樣本分組,每組樣本數(shù)量,樣本供體的納排標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)樣本的采集方法、體積/重量,現(xiàn)場(chǎng)前處理要求,儲(chǔ)存條件,樣本信息收集標(biāo)準(zhǔn)等內(nèi)容,避免產(chǎn)生錯(cuò)誤采集、混肴、交叉錯(cuò)配等問(wèn)題。 2、耗材、儲(chǔ)存、運(yùn)輸條件準(zhǔn)備:離心管/離心機(jī)、現(xiàn)場(chǎng)前處理試劑、移液槍、封口膜、樣本標(biāo)簽、干冰、保溫厚泡沫箱、-20℃/-80℃冰箱等均應(yīng)按標(biāo)準(zhǔn)準(zhǔn)備到位,最好是知名品牌,并經(jīng)過(guò)預(yù)試驗(yàn)驗(yàn)證,確保不會(huì)引入污染物;尋找有資質(zhì)的冷鏈運(yùn)輸服務(wù)供應(yīng)商提供樣本運(yùn)輸服務(wù),確保樣本不變質(zhì)。 3、樣本采集人員要求:需經(jīng)過(guò)系統(tǒng)培訓(xùn),熟悉樣本采集、現(xiàn)場(chǎng)前處理流程,操作規(guī)范、熟練,持證上崗。 4、樣本分組原則:通過(guò)篩查關(guān)鍵理化指標(biāo)、疾病診斷分類(lèi)/分級(jí),盡可能選擇指標(biāo)相近的樣本歸入同一組;若同時(shí)收集同一樣本供體的2種以上樣本(如血液、尿液),這2種樣本最好配對(duì)歸入同一樣本集,如發(fā)現(xiàn)集;從而盡可能降低同組、同集樣本間的個(gè)體差異。 5、樣本處理人員要求:需經(jīng)過(guò)系統(tǒng)培訓(xùn),熟悉樣本前處理流程,操作規(guī)范、熟練,持證上崗。 6、樣本質(zhì)量控制:確保樣本按規(guī)程一次解凍、快速取樣,避免反復(fù)凍融;通過(guò)外觀、理化指標(biāo)、光譜檢測(cè)、SDS-PAGE凝膠分析等,剔除溶血、降解等不合格樣本;同組樣本隨機(jī)篩選其中的20%,等量收集后混合,處理方法與實(shí)際樣品一致,制備質(zhì)控樣品(QC)。 7、樣本處理:不同類(lèi)型的樣本,如血液/尿液/組織等,需根據(jù)目標(biāo)分子的性質(zhì)、含量、干擾雜質(zhì)等情況,設(shè)計(jì)、摸索、優(yōu)化最佳前處理方法,以最大限度除去雜質(zhì)、保留目標(biāo)分子,或改變目標(biāo)分子性質(zhì),適應(yīng)檢測(cè)方法,或提升目標(biāo)分子的檢測(cè)靈敏度;鑒于實(shí)驗(yàn)過(guò)程復(fù)雜、步驟多,需高效、熟練、有序地按流程處理樣品,如移液時(shí)需避免上/下相交叉污染、避免氣泡,避免引入偶然誤差或污染物。 8、色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀的選擇、調(diào)試、校準(zhǔn):根據(jù)研究目的選擇合適的色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀;嚴(yán)格按照色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀的操作規(guī)程(SOP)進(jìn)行設(shè)備參數(shù)的設(shè)置、調(diào)試和校準(zhǔn),確保設(shè)備運(yùn)行準(zhǔn)確、穩(wěn)定。 9、樣品檢測(cè)方法的建立與優(yōu)化:參考已有文獻(xiàn)和試驗(yàn)積累,建立樣品分析檢測(cè)方法,包括色譜類(lèi)型、流動(dòng)性選擇,色譜梯度、流速、質(zhì)譜檢測(cè)參數(shù)設(shè)置等,并根據(jù)目標(biāo)分子的檢測(cè)靈敏度、準(zhǔn)確性、重現(xiàn)性、與雜質(zhì)的分離度等加以優(yōu)化和驗(yàn)證,確定最佳樣品分析檢測(cè)方法。 10、數(shù)據(jù)采集:均勻插入空白對(duì)照、標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照、QC樣品,一般每6-8次插入一個(gè)空白對(duì)照、標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照和/或QC樣品,以避免殘留影響、幫助色譜峰校準(zhǔn);將不同批次收集的樣本與對(duì)照樣本根據(jù)分析序列交替進(jìn)行數(shù)據(jù)采集,以避免批次效應(yīng);每個(gè)樣品中加入內(nèi)標(biāo),以幫助色譜峰校準(zhǔn)和儀器穩(wěn)定性監(jiān)測(cè);每個(gè)樣本重復(fù)檢測(cè)三次,取均值以避免偶然誤差。 11、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估:采用誤差分析、聚類(lèi)分析、主成分(PCA)分析、變異系數(shù)(CV)分析等方法,評(píng)估數(shù)據(jù)采集的質(zhì)量,若數(shù)據(jù)不合格,需重新采集、評(píng)估。 在組學(xué)研究過(guò)程中,如果嚴(yán)格按照上述方法進(jìn)行過(guò)程質(zhì)量控制,則基本可以獲得較高質(zhì)量的組學(xué)檢測(cè)數(shù)據(jù),為后續(xù)數(shù)據(jù)處理、差異分析、特征分子鑒定、分類(lèi)模型構(gòu)建和優(yōu)化奠定良好的基礎(chǔ)。 摩賽恩科技聚焦分子智能識(shí)別檢測(cè)技術(shù),開(kāi)發(fā)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)核心算法,提供專(zhuān)業(yè)化組學(xué)和質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理、挖掘服務(wù),滿足生物醫(yī)藥、食品等行業(yè)質(zhì)譜用戶個(gè)性化分子智能識(shí)別需求。在組學(xué)研究過(guò)程中,努力優(yōu)化組學(xué)研究過(guò)程中的質(zhì)量控制方法,才能為客戶呈現(xiàn)最好的組學(xué)研究結(jié)果! |
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