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貓球er新蟲 (初入文壇)
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[交流]
Pcr 吸蟲囊蚴序列比對，同源性分析問題求指教！
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蟲友們大家好，我目前做三種吸蟲囊蚴DNA測序，用的ITS2通用引物，雙向測序，目標520bp。華支睪和東方次睪囊蚴我在ncbi上都比對到結果了，可是臺灣次睪囊蚴比對出來是其他蟲種，可是通過形態(tài)鑒定我很肯定是臺灣。我也找不著那蟲的基因組，不知道是我不會找還是根本就沒有人做過這蟲的基因組，剛做基因，特別小白。。。 我想問如果在ncbi上沒我做的臺灣次睪吸蟲的基因組序列是不是說明沒有人上傳過��？那我就算提了囊蚴的基因組也沒辦法比對是嗎，那我還能用什么方法從分子角度證明囊蚴和成蟲是一個種呢，可以分別把囊蚴和成蟲進行測序然后進行比對嗎，哪個軟件可以做呢，DNAMAN ？mega.？看不太懂。 對了，我還要做一個系統(tǒng)發(fā)生樹，我看論文上別人用ITS2數(shù)據(jù)庫截取ITS2序列，520左右的bp最后只剩300左右。。第一次提問有點多，希望有高人指點，小妹感激不盡…… 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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貓球er
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2樓2021-11-05 07:42:11
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