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| 【有獎(jiǎng)交流】積極回復(fù)本帖子，參與交流，就有機(jī)會(huì)分得作者 貓球er 的 5 個(gè)金幣 | |||
貓球er新蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
Pcr 吸蟲(chóng)囊蚴序列比對(duì)，同源性分析問(wèn)題求指教！
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蟲(chóng)友們大家好，我目前做三種吸蟲(chóng)囊蚴DNA測(cè)序，用的ITS2通用引物，雙向測(cè)序，目標(biāo)520bp。華支睪和東方次睪囊蚴我在ncbi上都比對(duì)到結(jié)果了，可是臺(tái)灣次睪囊蚴比對(duì)出來(lái)是其他蟲(chóng)種，可是通過(guò)形態(tài)鑒定我很肯定是臺(tái)灣。我也找不著那蟲(chóng)的基因組，不知道是我不會(huì)找還是根本就沒(méi)有人做過(guò)這蟲(chóng)的基因組，剛做基因，特別小白。。。 我想問(wèn)如果在ncbi上沒(méi)我做的臺(tái)灣次睪吸蟲(chóng)的基因組序列是不是說(shuō)明沒(méi)有人上傳過(guò)�。磕俏揖退闾崃四因实幕蚪M也沒(méi)辦法比對(duì)是嗎，那我還能用什么方法從分子角度證明囊蚴和成蟲(chóng)是一個(gè)種呢，可以分別把囊蚴和成蟲(chóng)進(jìn)行測(cè)序然后進(jìn)行比對(duì)嗎，哪個(gè)軟件可以做呢，DNAMAN ？mega.？看不太懂。 對(duì)了，我還要做一個(gè)系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)，我看論文上別人用ITS2數(shù)據(jù)庫(kù)截取ITS2序列，520左右的bp最后只剩300左右。。第一次提問(wèn)有點(diǎn)多，希望有高人指點(diǎn)，小妹感激不盡…… 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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貓球er
新蟲(chóng) (初入文壇)
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- 專業(yè): 寄生蟲(chóng)、寄生蟲(chóng)感染與宿主
2樓2021-11-05 07:42:11
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