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[求助]
MS中focite模塊的能量計算 已有1人參與
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請教MS中能量計算文本中valence(diag.term)與valence(cross term)的關系 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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ff1fanfan
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7樓2024-04-12 21:09:35
200204121
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沒關系，你力場用的是COMPASS，它里面勢函數包含三項，分別是化學鍵項，主要考慮鍵長，鍵角，扭轉和二面角。能量交叉項和非鍵作用項主要考慮范德華力和靜電作用。三項之和構成總勢能。也即算出來的總能量 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2021-09-22 20:48:07
3樓2021-09-23 11:02:00
月只藍
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數 +1
劉星雨0120: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2021-09-23 11:07:02
感謝參與，應助指數 +1
劉星雨0120: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2021-09-23 11:07:02
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先正面回答樓主的問題，valence (diag.term)與valence (cross term)兩者肯定是有密切關系的。為了理解這個問題需要先了解COMPASS力場能量的組成： 總能量=鍵能+非鍵能 （valence energy + non-bond energy） =鍵能對角項+鍵能交叉項+非鍵能 [ valence (diag.term) +valence (cross term) + non-bond energy ] 其中，鍵能對角項，又包括以下子項目： 1 Valence energy (diag. terms)：鍵能對角項 1.1 Bond：鍵長的伸縮 1.2 Angle：鍵角的彎曲 1.3 Torsion：二面角的扭轉 1.4 Inversion（也稱out-of-plane interactions）：離平面的彎曲 很好想象，對于一個分子而言，其中的鍵長、鍵角、二面角任一發(fā)生了變化，那必然引起其他項的變化，比如鍵角的彎曲，同時會引起鍵長、二面角的變化，反過來也一樣。也就是說，分子中各種鍵能對角項的變化不是獨立的，而是互相影響彼此的，這種互相影響的關系，即稱之為交叉耦合（cross coupling）。由這種耦合貢獻的能量項，被稱之為鍵能交叉項（cross term，也稱off-diagonal term）。 鍵能交叉項包含的子項目如下： 2 Valence energy (cross terms) [全稱是 cross coupling terms]：鍵能中的交叉耦合項，簡稱鍵能交叉項 2.1 Stretch-Stretch：鍵長伸縮-鍵長伸縮兩者的耦合 2.2 Stretch-Bend-Stretch：鍵長伸縮-鍵角彎曲-鍵長伸縮三者的耦合 2.3 Stretch-Torsion-Stretch：鍵長伸縮-二面角扭轉-鍵長伸縮三者的耦合 2.4 Separated-Stretch-Stretch：獨立的鍵長伸縮-鍵長伸縮三者的耦合 2.5 Torsion-Stretch：二面角扭轉-鍵長伸縮兩者的耦合 2.6 Bend-Bend：鍵角彎曲-鍵角彎曲兩者的耦合 2.7 Torsion-Bend-Bend：二面角扭轉-鍵角彎曲-鍵角彎曲三者的耦合 2.8 Bend-Torsion-Bend：鍵角彎曲-二面角扭轉-鍵角彎曲三者的耦合 非鍵能包含的子項目如下： 3 Non-bond energy：非鍵能 3.1 van der Waals：范德華力能 3.2 Long range correction：范德華力能的長程修正項，適用于周期性模型，非周期性模型不含此項 3.3 Electrostatic：靜電力能 |
4樓2021-09-23 11:06:41
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