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xuannnn新蟲 (正式寫手)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 已有1人參與
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請(qǐng)問已有2種植物(野生型和突變型)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,如何找到某一基因在兩種植物中的表達(dá)量?如何將該基因的序列提取出來看其編碼蛋白序列是否發(fā)生變異?小白,希望大神告知可以用什么軟件解決問題 |
新蟲 (正式寫手)
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之前有其他人組裝過,并且做了基因差異表達(dá)和功能注釋的聚類分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)都聚集到花青素合成途徑了,關(guān)于類胡蘿卜素的合成并沒有差異表達(dá),請(qǐng)問有什么方法可以挑出轉(zhuǎn)錄組中關(guān)于類胡蘿卜素合成酶基因的表達(dá)量? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
新蟲 (小有名氣)
新蟲 (正式寫手)
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謝謝,我的物種沒有參考基因組,但是已經(jīng)組裝成unigene,有方法可以把某一基因的表達(dá)量調(diào)出來嗎 (新手小白求教)發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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