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xuannnn新蟲 (正式寫手)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 已有1人參與
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請問已有2種植物（野生型和突變型）的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果，如何找到某一基因在兩種植物中的表達(dá)量？如何將該基因的序列提取出來看其編碼蛋白序列是否發(fā)生變異？小白，希望大神告知可以用什么軟件解決問題 |
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2樓2021-09-15 00:07:46
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3樓2021-09-15 00:08:47
xuannnn
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謝謝，我的物種沒有參考基因組，但是已經(jīng)組裝成unigene，有方法可以把某一基因的表達(dá)量調(diào)出來嗎 （新手小白求教）發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2021-09-15 08:59:33
xuannnn
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之前有其他人組裝過，并且做了基因差異表達(dá)和功能注釋的聚類分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)都聚集到花青素合成途徑了，關(guān)于類胡蘿卜素的合成并沒有差異表達(dá)，請問有什么方法可以挑出轉(zhuǎn)錄組中關(guān)于類胡蘿卜素合成酶基因的表達(dá)量？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2021-09-15 09:04:07
kobee57
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如果有人做過轉(zhuǎn)錄組分析，你可以根據(jù)相關(guān)基因把表達(dá)量結(jié)果提取出來，沒人做的話，就只能只有自己提RNA，做定量 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
6樓2021-09-15 15:56:00
kobee57
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根據(jù)他基因注解，把相關(guān)的基因挑出來就可以做了 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
7樓2021-09-15 15:56:56
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