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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 生物科學 » 蛋白/酶 » 雙底物動力學公式計算
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雙底物動力學公式計算 已有1人參與
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第一次，接觸雙底物的動力學計算，我查閱文獻看文章中是在不同濃度的底物b下，改變底物a的濃度，每個濃度底物b下，根據雙導數作圖擬合成直線，然后需要根據公式計算，出kma、vmax、kmb等。但雙底物動力學公式有3種:隨機機制、順序機制、乒乓機制（乒乓機制還包括單底物抑制，需要求kmb'）。但我做出曲線了，但不知道它應該用哪個公式，也不知道怎樣計算出kma、kmb、vamx等。請問我應該選擇哪個公式呢？有應該如何計算呢？還是只用其他軟件擬合就可以直接得出kma、vamx、kmb嗎？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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fuyuandj86
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- 管轄: 生物科學
【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數 +1
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雙底物模型一般是指轉移酶之類的東西把底物A的一部分接到底物B上。 比如說把一個甲基從SAM分子上弄下來轉移到腺嘌呤上，就是DNA甲基轉移酶。 那么這個甲基轉移酶既要結合SAM，也要結合腺嘌呤。 ping-pong model是指SAM先把甲基轉移到酶上，然后酶再把甲基轉移到DNA上，整個反應其實是分兩步完成的。 ternary complex model是指SAM直接把甲基轉移到腺嘌呤上，整個反應一步完成。 其中ternary complex又分為兩種： compulsory order是指，酶結合SAM和腺嘌呤必須按照一定順序，必須先結合一個才能結合另一個。 random order是指，酶結合SAM和腺嘌呤不需要服從順序，先結合哪個都行。 |
2樓2021-03-07 10:31:39
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我想請問一下問的是應該使用哪個公式。我感覺我一個使用第一個乒乓機制的公式，但乒乓機制的公式中的所有的斜率為kma/vmax，但為什么我的每條直線的斜率都不同呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2021-03-11 10:55:56
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