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點(diǎn)點(diǎn)兔新蟲 (小有名氣)
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[求助]
雙底物動(dòng)力學(xué)公式計(jì)算 已有1人參與
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第一次，接觸雙底物的動(dòng)力學(xué)計(jì)算，我查閱文獻(xiàn)看文章中是在不同濃度的底物b下，改變底物a的濃度，每個(gè)濃度底物b下，根據(jù)雙導(dǎo)數(shù)作圖擬合成直線，然后需要根據(jù)公式計(jì)算，出kma、vmax、kmb等。但雙底物動(dòng)力學(xué)公式有3種:隨機(jī)機(jī)制、順序機(jī)制、乒乓機(jī)制（乒乓機(jī)制還包括單底物抑制，需要求kmb'）。但我做出曲線了，但不知道它應(yīng)該用哪個(gè)公式，也不知道怎樣計(jì)算出kma、kmb、vamx等。請(qǐng)問我應(yīng)該選擇哪個(gè)公式呢？有應(yīng)該如何計(jì)算呢？還是只用其他軟件擬合就可以直接得出kma、vamx、kmb嗎？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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雙底物模型一般是指轉(zhuǎn)移酶之類的東西把底物A的一部分接到底物B上。 比如說把一個(gè)甲基從SAM分子上弄下來轉(zhuǎn)移到腺嘌呤上，就是DNA甲基轉(zhuǎn)移酶。 那么這個(gè)甲基轉(zhuǎn)移酶既要結(jié)合SAM，也要結(jié)合腺嘌呤。 ping-pong model是指SAM先把甲基轉(zhuǎn)移到酶上，然后酶再把甲基轉(zhuǎn)移到DNA上，整個(gè)反應(yīng)其實(shí)是分兩步完成的。 ternary complex model是指SAM直接把甲基轉(zhuǎn)移到腺嘌呤上，整個(gè)反應(yīng)一步完成。 其中ternary complex又分為兩種： compulsory order是指，酶結(jié)合SAM和腺嘌呤必須按照一定順序，必須先結(jié)合一個(gè)才能結(jié)合另一個(gè)。 random order是指，酶結(jié)合SAM和腺嘌呤不需要服從順序，先結(jié)合哪個(gè)都行。 |
2樓2021-03-07 10:31:39
點(diǎn)點(diǎn)兔
新蟲 (小有名氣)
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我想請(qǐng)問一下問的是應(yīng)該使用哪個(gè)公式。我感覺我一個(gè)使用第一個(gè)乒乓機(jī)制的公式，但乒乓機(jī)制的公式中的所有的斜率為kma/vmax，但為什么我的每條直線的斜率都不同呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2021-03-11 10:55:56
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