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[交流]
如何利用MS計算水的自擴散系數(shù) 已有2人參與
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各位老師和科研兄弟姐妹們，我想用MS計算水的自擴散系數(shù)，但是算的值一直比實驗值2.39e-9大兩倍左右。計算方法如下。 1.Amorphous建立含有500個水分子的體系并進行geometry優(yōu)化， 2.NPT系綜，COMPASS力場，控溫veolicity-scale,控壓-berendsen,靜電作用-Ewald, VDW-atom based,cut-off為盒子的一半，500ps模擬 3.密度穩(wěn)定后，切換到NVT系綜，控溫NHL,非鍵作用同上，1000ps模擬 4.設置sets后，對XTD進行MSD再計算斜率 不知哪里出了問題，請各位指點一二。 |
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@月只藍
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3樓2020-12-15 22:00:49
郭同學
金蟲 (著名寫手)
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- 專業(yè): 化學工程及工業(yè)化學
2樓2020-12-15 20:17:19
4樓2021-04-06 11:13:47
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