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22306891新蟲 (正式寫手)
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[求助]
VASP運(yùn)行時(shí),查不到PID
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作為剛接觸VASP計(jì)算的小白,遇到以下問題,請(qǐng)各位大神或老師給解答一下吧。 問題一:在提交VASP(VASP.5.4.4)任務(wù)后,在前臺(tái)有計(jì)算數(shù)據(jù)輸出,但top命令查看PID時(shí)發(fā)現(xiàn)沒有VASP任務(wù)對(duì)應(yīng)的PID號(hào)。用的是自己實(shí)驗(yàn)室自配的工作站,兩個(gè)節(jié)點(diǎn)一共44個(gè)核。我提交任務(wù)出現(xiàn)這種情況,另一個(gè)同學(xué)同樣提交任務(wù)就顯示了PID號(hào)。請(qǐng)問這是什么原因? 問題二:在這種情況下,如何停止正在運(yùn)行的任務(wù)。 問題三:在問題一出現(xiàn)之前的問題是VASP一直顯示在運(yùn)行,也有分配PID號(hào),但不更新輸出數(shù)據(jù)。根據(jù)前輩給出的意見,更新了編譯器(parallel_studio_xe_2019_update1_cluster_edition.tgz)。在進(jìn)行Si64Li32體系的分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算時(shí),沒有再出現(xiàn)數(shù)據(jù)不更新的情況了。但在進(jìn)行Li3Co3O6的2*2*1的結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程中,又出現(xiàn)了這個(gè)問題。 |
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