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22306891新蟲 (正式寫手)
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[求助]
VASP運行時,查不到PID
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作為剛接觸VASP計算的小白,遇到以下問題,請各位大神或老師給解答一下吧。 問題一:在提交VASP(VASP.5.4.4)任務(wù)后,在前臺有計算數(shù)據(jù)輸出,但top命令查看PID時發(fā)現(xiàn)沒有VASP任務(wù)對應(yīng)的PID號。用的是自己實驗室自配的工作站,兩個節(jié)點一共44個核。我提交任務(wù)出現(xiàn)這種情況,另一個同學同樣提交任務(wù)就顯示了PID號。請問這是什么原因? 問題二:在這種情況下,如何停止正在運行的任務(wù)。 問題三:在問題一出現(xiàn)之前的問題是VASP一直顯示在運行,也有分配PID號,但不更新輸出數(shù)據(jù)。根據(jù)前輩給出的意見,更新了編譯器(parallel_studio_xe_2019_update1_cluster_edition.tgz)。在進行Si64Li32體系的分子動力學計算時,沒有再出現(xiàn)數(shù)據(jù)不更新的情況了。但在進行Li3Co3O6的2*2*1的結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程中,又出現(xiàn)了這個問題。 |
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