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yyy0305至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
轉錄因子結合位點實驗驗證設計思路
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從現(xiàn)有的文獻資料數(shù)據(jù)庫得到的轉錄因子的核苷酸結合位點的motif,怎么設計一段核苷酸序列放在Minimal promoter前面驗證其啟動結合活性? 我現(xiàn)在掌握的一些資料只允許我進行模仿,但沒有獨立思考的能力,分享出來和大家討論下 我從Promega的官網(wǎng)上找到了NF-KB轉錄因子信號通路的設計,設計包括由一段轉錄因子結合位點和一個Minimal promoter的連續(xù)核苷酸序列,后面接一個luciferase的基因,如下: GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC 兩個不同NF-KB motif的重復組合 AGATCTGGCCTCGGCGGCCAAGCTTAGACACTA 不知道這段的作用是什么? GAGGGTATATAATGGAAGCTCGACTTCCAG Minimal promotor 請問一下在設計類似的轉錄因子結合位點時,一般設計的原則是什么?如轉錄因子結合位點的motif如何進行重復和穿插設計,在結合位點和Minimal Promtor的核苷酸之間是否需要添加一段的核苷酸序列,這段序列的作用是什么?@biostar2009@wizardfan |
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