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yyy0305至尊木蟲 (著名寫手)
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轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證設(shè)計(jì)思路
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從現(xiàn)有的文獻(xiàn)資料數(shù)據(jù)庫得到的轉(zhuǎn)錄因子的核苷酸結(jié)合位點(diǎn)的motif，怎么設(shè)計(jì)一段核苷酸序列放在Minimal promoter前面驗(yàn)證其啟動結(jié)合活性？ 我現(xiàn)在掌握的一些資料只允許我進(jìn)行模仿，但沒有獨(dú)立思考的能力，分享出來和大家討論下 我從Promega的官網(wǎng)上找到了NF-KB轉(zhuǎn)錄因子信號通路的設(shè)計(jì)，設(shè)計(jì)包括由一段轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)和一個(gè)Minimal promoter的連續(xù)核苷酸序列，后面接一個(gè)luciferase的基因，如下： GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC 兩個(gè)不同NF-KB motif的重復(fù)組合 AGATCTGGCCTCGGCGGCCAAGCTTAGACACTA 不知道這段的作用是什么？ GAGGGTATATAATGGAAGCTCGACTTCCAG Minimal promotor 請問一下在設(shè)計(jì)類似的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)時(shí)，一般設(shè)計(jì)的原則是什么？如轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的motif如何進(jìn)行重復(fù)和穿插設(shè)計(jì)，在結(jié)合位點(diǎn)和Minimal Promtor的核苷酸之間是否需要添加一段的核苷酸序列，這段序列的作用是什么？@biostar2009@wizardfan |
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2樓2020-07-28 13:34:54
3樓2021-05-04 20:51:50
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