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Journal of Hepatology | 博奧晶典單細胞項目文章揭示腫瘤基
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2020年6月4日，博奧晶典單細胞合作客戶北京工業(yè)大學環(huán)境與生命學部閻新龍教授團隊、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心劉兵研究員團隊、軍事科學院軍事醫(yī)學研究院裴雪濤研究員團隊和岳文研究員團隊合作在肝領(lǐng)域權(quán)威期刊 Journal of Hepatology（IF=20.582） 在線發(fā)表了題為“Single cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究成果。該研究首次利用單細胞RNA測序技術(shù)在單細胞尺度分析人肝內(nèi)膽管細胞癌組織中成纖維細胞亞群與腫瘤細胞之間的相互作用，并通過體內(nèi)外實驗進行功能驗證和機制研究。 博奧晶典為該研究給了單細胞測序技術(shù)服務(wù)。 至此，博奧晶典單細胞平臺已經(jīng)支持客戶發(fā)表 17篇 高水平科研論文，累計影響因子 246.385 ！接下來小編帶大家一起看一下這篇文章的主要研究內(nèi)容。 單細胞測序揭示腫瘤基質(zhì)微環(huán)境 在肝內(nèi)膽管細胞癌中的作用 Single cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma 【發(fā)表期刊】Journal of Hepatology 【影響因子】20.582 【發(fā)表時間】2020年6月 【關(guān)鍵詞】肝內(nèi)膽管癌、單細胞測序、腫瘤異質(zhì)性 研究背景 肝內(nèi)膽管細胞癌（Intrahepatic cholangiocarcinoma，ICC）是肝第二大最常見的惡性腫瘤。肝內(nèi)膽管細胞癌具有顯著的腫瘤異質(zhì)性和纖維組織異常增生現(xiàn)象（desmoplastic stromal reaction）。腫瘤組織內(nèi)部復雜的細胞間通訊以及免疫細胞和基質(zhì)細胞分泌的細胞因子、趨化因子和基質(zhì)成分等協(xié)同促進了腫瘤生長。因此，在單細胞水平系統(tǒng)性解析ICC的轉(zhuǎn)錄組結(jié)構(gòu)，尤其是腫瘤中激活的基質(zhì)細胞在肝內(nèi)膽管細胞癌中的作用，對于闡明驅(qū)動ICC進展的機制和發(fā)現(xiàn)新的治療方法至關(guān)重要。 研究結(jié)果 1單細胞測序繪制肝內(nèi)膽管癌細胞圖譜 利用單細胞RNA測序技術(shù)(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)繪制了肝內(nèi)膽管癌細胞圖譜，得到10個細胞亞群，并鑒定了各個亞群的marker基因。在單細胞尺度分析人肝內(nèi)膽管細胞癌組織中成纖維細胞亞群與腫瘤細胞之間的相互作用。 2單細胞測序發(fā)現(xiàn)vCAF新亞群 單細胞測序發(fā)現(xiàn)并且定義了六個成纖維細胞亞群，其中MCAM 陽性的血管樣特征的成纖維細胞 (vascular cancer-associated fibroblasts，vCAF）占比最高，并且基于推斷的受配體分析發(fā)現(xiàn)vCAF和ICC細胞富集了IL6-IL6R受配體對。 3體外實驗驗證vCAF亞群功能 研究人員經(jīng)流式分選并擴大培養(yǎng)vCAF亞群，通過體內(nèi)外實驗發(fā)現(xiàn)血管樣成纖維細胞亞群能夠顯著促進腫瘤和腫瘤干細胞球增殖。進一步通過高通量芯片分析發(fā)現(xiàn)vCAF亞群能夠顯著誘導腫瘤細胞中表觀遺傳調(diào)控相關(guān)的多個通路改變，包括EZH2的表達上調(diào)。大量的體內(nèi)外功能學實驗證明了vCAF亞群可以通過IL-6 / IL-6受體（IL-6R）顯著誘導腫瘤細胞中EZH2表達上調(diào)，并增強ICC惡性程度。反過來ICC腫瘤細胞的外泌體能夠攜帶miR-9-5p上調(diào)vCAF中的IL-6表達，從而促進ICC惡性進程。 研究結(jié)論與意義 該研究結(jié)果給了人肝內(nèi)膽管細胞癌中單細胞分辨率的轉(zhuǎn)錄組概貌（landscape），為闡明ICC腫瘤異質(zhì)性給了完善的數(shù)據(jù)資源，并在單細胞層面和體內(nèi)外功能水平剖析了ICC細胞與vCAF之間的相互作用，揭示了ICC治療的潛在靶標。 據(jù)悉，該項研究由北京工業(yè)大學、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心、軍事科學院軍事醫(yī)學研究院等機構(gòu)合作完成。北京工業(yè)大學環(huán)境與生命學部閻新龍教授、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心劉兵研究員、軍事科學院軍事醫(yī)學研究院裴雪濤研究員、岳文研究員為文章的共同通訊作者。軍事醫(yī)學研究院博士生章敏、北京工業(yè)大學碩士生楊慧和萬令飛、解放軍總醫(yī)院王兆海主任醫(yī)師、軍事醫(yī)學研究院博士生王海洋為論文的共同第一作者。該課題獲得北京市長城學者人才計劃、北京工業(yè)大學高層次人才計劃、國家自然科學基金等項目的資助。 |
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