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Journal of Hepatology | 博奧晶典單細(xì)胞項(xiàng)目文章揭示腫瘤基
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2020年6月4日，博奧晶典單細(xì)胞合作客戶北京工業(yè)大學(xué)環(huán)境與生命學(xué)部閻新龍教授團(tuán)隊(duì)、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心劉兵研究員團(tuán)隊(duì)、軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院裴雪濤研究員團(tuán)隊(duì)和岳文研究員團(tuán)隊(duì)合作在肝領(lǐng)域權(quán)威期刊 Journal of Hepatology（IF=20.582） 在線發(fā)表了題為“Single cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究成果。該研究首次利用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)在單細(xì)胞尺度分析人肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌組織中成纖維細(xì)胞亞群與腫瘤細(xì)胞之間的相互作用，并通過體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)進(jìn)行功能驗(yàn)證和機(jī)制研究。 博奧晶典為該研究給了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)服務(wù)。 至此，博奧晶典單細(xì)胞平臺(tái)已經(jīng)支持客戶發(fā)表 17篇 高水平科研論文，累計(jì)影響因子 246.385 ！接下來(lái)小編帶大家一起看一下這篇文章的主要研究?jī)?nèi)容。 單細(xì)胞測(cè)序揭示腫瘤基質(zhì)微環(huán)境 在肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌中的作用 Single cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma 【發(fā)表期刊】Journal of Hepatology 【影響因子】20.582 【發(fā)表時(shí)間】2020年6月 【關(guān)鍵詞】肝內(nèi)膽管癌、單細(xì)胞測(cè)序、腫瘤異質(zhì)性 研究背景 肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌（Intrahepatic cholangiocarcinoma，ICC）是肝第二大最常見的惡性腫瘤。肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌具有顯著的腫瘤異質(zhì)性和纖維組織異常增生現(xiàn)象（desmoplastic stromal reaction）。腫瘤組織內(nèi)部復(fù)雜的細(xì)胞間通訊以及免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞分泌的細(xì)胞因子、趨化因子和基質(zhì)成分等協(xié)同促進(jìn)了腫瘤生長(zhǎng)。因此，在單細(xì)胞水平系統(tǒng)性解析ICC的轉(zhuǎn)錄組結(jié)構(gòu)，尤其是腫瘤中激活的基質(zhì)細(xì)胞在肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌中的作用，對(duì)于闡明驅(qū)動(dòng)ICC進(jìn)展的機(jī)制和發(fā)現(xiàn)新的治療方法至關(guān)重要。 研究結(jié)果 1單細(xì)胞測(cè)序繪制肝內(nèi)膽管癌細(xì)胞圖譜 利用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)繪制了肝內(nèi)膽管癌細(xì)胞圖譜，得到10個(gè)細(xì)胞亞群，并鑒定了各個(gè)亞群的marker基因。在單細(xì)胞尺度分析人肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌組織中成纖維細(xì)胞亞群與腫瘤細(xì)胞之間的相互作用。 2單細(xì)胞測(cè)序發(fā)現(xiàn)vCAF新亞群 單細(xì)胞測(cè)序發(fā)現(xiàn)并且定義了六個(gè)成纖維細(xì)胞亞群，其中MCAM 陽(yáng)性的血管樣特征的成纖維細(xì)胞 (vascular cancer-associated fibroblasts，vCAF）占比最高，并且基于推斷的受配體分析發(fā)現(xiàn)vCAF和ICC細(xì)胞富集了IL6-IL6R受配體對(duì)。 3體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證vCAF亞群功能 研究人員經(jīng)流式分選并擴(kuò)大培養(yǎng)vCAF亞群，通過體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)血管樣成纖維細(xì)胞亞群能夠顯著促進(jìn)腫瘤和腫瘤干細(xì)胞球增殖。進(jìn)一步通過高通量芯片分析發(fā)現(xiàn)vCAF亞群能夠顯著誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞中表觀遺傳調(diào)控相關(guān)的多個(gè)通路改變，包括EZH2的表達(dá)上調(diào)。大量的體內(nèi)外功能學(xué)實(shí)驗(yàn)證明了vCAF亞群可以通過IL-6 / IL-6受體（IL-6R）顯著誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞中EZH2表達(dá)上調(diào)，并增強(qiáng)ICC惡性程度。反過來(lái)ICC腫瘤細(xì)胞的外泌體能夠攜帶miR-9-5p上調(diào)vCAF中的IL-6表達(dá)，從而促進(jìn)ICC惡性進(jìn)程。 研究結(jié)論與意義 該研究結(jié)果給了人肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌中單細(xì)胞分辨率的轉(zhuǎn)錄組概貌（landscape），為闡明ICC腫瘤異質(zhì)性給了完善的數(shù)據(jù)資源，并在單細(xì)胞層面和體內(nèi)外功能水平剖析了ICC細(xì)胞與vCAF之間的相互作用，揭示了ICC治療的潛在靶標(biāo)。 據(jù)悉，該項(xiàng)研究由北京工業(yè)大學(xué)、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心、軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院等機(jī)構(gòu)合作完成。北京工業(yè)大學(xué)環(huán)境與生命學(xué)部閻新龍教授、解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心劉兵研究員、軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院裴雪濤研究員、岳文研究員為文章的共同通訊作者。軍事醫(yī)學(xué)研究院博士生章敏、北京工業(yè)大學(xué)碩士生楊慧和萬(wàn)令飛、解放軍總醫(yī)院王兆海主任醫(yī)師、軍事醫(yī)學(xué)研究院博士生王海洋為論文的共同第一作者。該課題獲得北京市長(zhǎng)城學(xué)者人才計(jì)劃、北京工業(yè)大學(xué)高層次人才計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。 |
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