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藍(lán)蝶夢新蟲 (小有名氣)
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Gaussian適合算高分子PTFE和氫離子的吸附情形嗎 已有1人參與
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我想得到PTFE分子表面吸附一個氫離子的靜電勢能圖。我用Gaussian試了一下。 1. 如果優(yōu)化前，在atom groups里把H的charge設(shè)置為1。然后，DFT優(yōu)化之后，再點開atom groups看，H的charge又自動變成0了。 2. 如果優(yōu)化前，在優(yōu)化設(shè)置界面把整體的charge設(shè)置為1，然后DFT優(yōu)化。優(yōu)化結(jié)果和上一條的結(jié)果一模一樣。 我的問題是： 1. 用Gaussian做這件事是否合理？應(yīng)該換哪種軟件？ 2. 如果可以用Gaussian做，那又如何讓H是離子而不是原子？ 謝謝！ |
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藍(lán)蝶夢
新蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhou2009: 金幣+5 2020-07-10 14:07:48
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| 高斯是量化計算，把高分子和H離子看作一個整體。你只能設(shè)定整個體系的電荷量。至于這個電荷具體在哪里，那得計算完成后查看電荷的分布。不存在某個電荷定域在某一個原子上的情形。電荷都是離域的 分散在整個分子上的不是。只是有的地方多有的地方少而已。不能人為的吧電荷加在某一個地方的。 用高斯去計算，就設(shè)置好整個體系的電荷，算完之后直接做靜電勢的圖就可以了。不過高斯這種計算真空中孤立體系的量化計算軟件并不適合做高分子的計算�？梢栽囋囉胐mol3之類的可以計算周期性體系的軟件去算靜電勢的 |
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2樓2020-07-10 10:15:27
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