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藍(lán)蝶夢(mèng)新蟲 (小有名氣)
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Gaussian適合算高分子PTFE和氫離子的吸附情形嗎 已有1人參與
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我想得到PTFE分子表面吸附一個(gè)氫離子的靜電勢(shì)能圖。我用Gaussian試了一下。 1. 如果優(yōu)化前，在atom groups里把H的charge設(shè)置為1。然后，DFT優(yōu)化之后，再點(diǎn)開atom groups看，H的charge又自動(dòng)變成0了。 2. 如果優(yōu)化前，在優(yōu)化設(shè)置界面把整體的charge設(shè)置為1，然后DFT優(yōu)化。優(yōu)化結(jié)果和上一條的結(jié)果一模一樣。 我的問題是： 1. 用Gaussian做這件事是否合理？應(yīng)該換哪種軟件？ 2. 如果可以用Gaussian做，那又如何讓H是離子而不是原子？ 謝謝！ |
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paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 高斯是量化計(jì)算，把高分子和H離子看作一個(gè)整體。你只能設(shè)定整個(gè)體系的電荷量。至于這個(gè)電荷具體在哪里，那得計(jì)算完成后查看電荷的分布。不存在某個(gè)電荷定域在某一個(gè)原子上的情形。電荷都是離域的 分散在整個(gè)分子上的不是。只是有的地方多有的地方少而已。不能人為的吧電荷加在某一個(gè)地方的。 用高斯去計(jì)算，就設(shè)置好整個(gè)體系的電荷，算完之后直接做靜電勢(shì)的圖就可以了。不過高斯這種計(jì)算真空中孤立體系的量化計(jì)算軟件并不適合做高分子的計(jì)算。可以試試用dmol3之類的可以計(jì)算周期性體系的軟件去算靜電勢(shì)的 |
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藍(lán)蝶夢(mèng)2樓2020-07-10 10:15:27
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3樓2021-03-01 20:10:30
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