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泛癌基因家族分析(泛癌多基因的藥物敏感性分析)
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泛癌基因家族分析(泛癌多基因的藥物敏感性分析) --生信自學網 今天我們給大家講解下泛癌基因家族分析(泛癌多基因文章套路)，這個目前比較熱的一個課題�；蚣易澹╣ene family），是指來源于同一個祖先，由一個基因通過基因重復而產生兩個或更多的拷貝而構成的一組基因，它們在結構和功能上具有明顯的相似性，編碼相似的蛋白質產物。在泛癌的背景下，加上基因家族的分析，就形成了多癌種多基因的文章套路。泛癌基因家族分析將多個癌癥中的多個基因進行聯(lián)合分析，觀察家族中的基因在正常和腫瘤的差異情況，以及基因與生存、腫瘤微環(huán)境、腫瘤干細胞的相關性分析。同時，我們找出基因的改變與藥物敏感性的關系。 課程內容包括：泛癌多基因文章套路，軟件準備，泛癌數(shù)據下載，id轉換，提取目標基因，泛癌基因表達水平，泛癌差異分析，泛癌差異分析熱圖，基因相關性分析，生存分析輸入文件，生存分析KM，COX分析，免疫亞型分析，腫瘤微環(huán)境，腫瘤微環(huán)境相關性，腫瘤干細胞相關性（RNAss），腫瘤干細胞相關性（DNAss），藥物敏感性，單腫瘤免疫亞型相關性，單腫瘤臨床相關性，單腫瘤微環(huán)境和干細胞指數(shù)。 01.png 02.png 03.png 04.png 05.png 06.png 07.png 08.png 09.png 10.png 11.png 12.png 13.png 14.png |
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