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生信自學(xué)網(wǎng)鐵蟲 (小有名氣)
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泛癌基因家族分析(泛癌多基因的藥物敏感性分析)
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泛癌基因家族分析(泛癌多基因的藥物敏感性分析) --生信自學(xué)網(wǎng) 今天我們給大家講解下泛癌基因家族分析(泛癌多基因文章套路)，這個目前比較熱的一個課題。基因家族（gene family），是指來源于同一個祖先，由一個基因通過基因重復(fù)而產(chǎn)生兩個或更多的拷貝而構(gòu)成的一組基因，它們在結(jié)構(gòu)和功能上具有明顯的相似性，編碼相似的蛋白質(zhì)產(chǎn)物。在泛癌的背景下，加上基因家族的分析，就形成了多癌種多基因的文章套路。泛癌基因家族分析將多個癌癥中的多個基因進(jìn)行聯(lián)合分析，觀察家族中的基因在正常和腫瘤的差異情況，以及基因與生存、腫瘤微環(huán)境、腫瘤干細(xì)胞的相關(guān)性分析。同時，我們找出基因的改變與藥物敏感性的關(guān)系。 課程內(nèi)容包括：泛癌多基因文章套路，軟件準(zhǔn)備，泛癌數(shù)據(jù)下載，id轉(zhuǎn)換，提取目標(biāo)基因，泛癌基因表達(dá)水平，泛癌差異分析，泛癌差異分析熱圖，基因相關(guān)性分析，生存分析輸入文件，生存分析KM，COX分析，免疫亞型分析，腫瘤微環(huán)境，腫瘤微環(huán)境相關(guān)性，腫瘤干細(xì)胞相關(guān)性（RNAss），腫瘤干細(xì)胞相關(guān)性（DNAss），藥物敏感性，單腫瘤免疫亞型相關(guān)性，單腫瘤臨床相關(guān)性，單腫瘤微環(huán)境和干細(xì)胞指數(shù)。 01.png 02.png 03.png 04.png 05.png 06.png 07.png 08.png 09.png 10.png 11.png 12.png 13.png 14.png |
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