 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1309 | 回復: 5 | |||
科爾夫斯基新蟲 (初入文壇)
|
[交流]
想問一下老師：甲基化測序是否需要設置生物學重復？一般多少個合適呢？ 已有4人參與
|
| 想問一下老師：甲基化測序是否需要設置生物學重復？一般多少個合適呢？ |
回復此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有75人回復
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復
2樓2020-06-17 00:52:42
fgh1124
鐵蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 59.5
- 帖子: 9
- 在線: 6.9小時
- 蟲號: 221656
- 注冊: 2006-03-20
- 專業(yè): 基因表達調(diào)控與表觀遺傳學
3樓2020-06-19 09:04:21
hulqi
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1144.2
- 散金: 106
- 紅花: 4
- 帖子: 361
- 在線: 56小時
- 蟲號: 568420
- 注冊: 2008-06-03
- 專業(yè): 微生物資源與分類學
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
|
曾經(jīng)有一篇文章討論過這個問題，主要觀點如下， 二代測序及基因芯片技術(shù)使得過去的十多年涌現(xiàn)出大量關(guān)于RNA-seq的研究。但似乎一些研究人員沒有注意到，基因表達的異質(zhì)性不僅僅是由技術(shù)誤差導致的�；虮磉_是一個相對隨機的過程，同一類型樣本中的不同個體，基因的表達可能會不一樣。一般來說，基因表達的異質(zhì)性（Var(Expr)）可以被分解為以下三個部分： Var(Expr) = Across Group Variability + Measurement Error + Biological Variability。 Across Group Variability即由于不同的處理或不同的細胞類型等導致的表達水平差異，即通常所說的組間差異。例如，腫瘤樣本與正常樣本之間的表達差異。 Measurement Error指實驗或測序過程中的技術(shù)誤差。技術(shù)誤差會導致一定的基因表達異質(zhì)性，但其可以通過對同一樣本進行多次實驗/測序（即技術(shù)重復）來消除。 Biological Variability指同一分組的不同樣本之間的表達差異。即使排除掉Measurement Error，這種樣本間的表達差異也是存在的，即無法通過測序來消除Biological Variability。 在實驗設計中，如果關(guān)注的是組間差異（Across Group Variability），那么Measurement Error和Biological Variability就會成為影響分析結(jié)果的因素。 Measurement Error可以通過技術(shù)重復來消除，但是Biological Variability為何不能通過測序來消除。因此只要你關(guān)注組間差異，不論是哪種測序數(shù)據(jù)都需要重復樣本。具體關(guān)于甲基化的數(shù)據(jù)，你可以去檢索一下易基因的公眾號，他們專門做甲基化的，我記得里面有專門的文章解讀了需不需要重復的問題 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2020-06-28 12:31:02
zhuchun0102
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
- 應助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 19774.4
- 紅花: 23
- 帖子: 3367
- 在線: 158.1小時
- 蟲號: 2221266
- 注冊: 2013-01-04
- 專業(yè): 臨床生物化學檢驗
5樓2020-07-07 12:18:00
zhuchun0102
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
- 應助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 19774.4
- 紅花: 23
- 帖子: 3367
- 在線: 158.1小時
- 蟲號: 2221266
- 注冊: 2013-01-04
- 專業(yè): 臨床生物化學檢驗
6樓2020-07-07 12:19:31
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 科爾夫斯基 的主題更新
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +5 | 一二LV 2026-03-07 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +8 | 朝天椒的雙馬尾 2026-03-05 | 8/400 |
|
|
[考研] 中科大材料299求調(diào)劑 +9 | DAIjiayo 2026-03-05 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑 +4 | fjj0912 2026-03-03 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 申博 +3 | 添菜了哈 2026-03-04 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料學碩318求調(diào)劑 +21 | February_Feb 2026-03-01 | 24/1200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工（高分子）290分求調(diào)劑 +9 | wengyujian 2026-03-04 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工求調(diào)劑！ +5 | 化工考生111 2026-03-04 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求調(diào)劑 +7 | 邱gl 2026-03-05 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +5 | Bananaiy 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學085600 319分 材料與化工 金屬方向 求調(diào)劑 +6 | 青科11 2026-03-02 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程專碩307 一志愿211 四六級已過 求調(diào)劑 +5 | ccc! 2026-03-03 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學 學碩 理工科均可 不區(qū)分研究方向 總分279求調(diào)劑 +7 | 1一11 2026-03-03 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料學碩080500復試調(diào)劑294 +3 | 四葉zjz 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學求調(diào)劑，總分320分，一志愿中南民族大學 +3 | 19286712440 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +9 | ErMiao1020 2026-03-02 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 江蘇省農(nóng)科院招調(diào)劑1名 +5 | Qwertyuop 2026-03-01 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 11408，學碩276求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-02 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +3 | 熊境喆 2026-03-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 295復試調(diào)劑 +3 | 簡木ChuFront 2026-03-01 | 3/150 |
|