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jing182銀蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
求幫忙找SHARP蛋白的基因片段 已有1人參與
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求助大神幫忙找下面這篇文章的gene,想要表達(dá)SHARP蛋白 (286個(gè)氨基酸),已找到包含這個(gè)序列的總體基因,但是針對(duì)SHARP的基因片段卻找不到。 The crystal structure of the Split End protein SHARP adds a new layer of complexity to proteins containing RNA recognition motifs 想要表達(dá)的蛋白質(zhì)序列 FGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREER 包含此序列的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuc ... ;amp;report=genbank, 非常感謝! |
銀蟲(chóng) (初入文壇)
新蟲(chóng) (初入文壇)
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這個(gè)就比對(duì)比較麻煩,不斷組合篩選 先把DNA序列通過(guò)網(wǎng)頁(yè)或軟件轉(zhuǎn)換成AA氨基酸序列 ctrl + F 比對(duì)相同氨基酸,找到比例位置,通過(guò)氨基酸位置,計(jì)算序列跨度,也就是氨基酸的個(gè)數(shù)x3就是跨越的基因序列長(zhǎng)度 然后通過(guò)氨基酸密碼子表,再核對(duì)check ,是否正確就行 費(fèi)時(shí) |
新蟲(chóng) (初入文壇)
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