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jing182銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
求幫忙找SHARP蛋白的基因片段 已有1人參與
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求助大神幫忙找下面這篇文章的gene，想要表達(dá)SHARP蛋白 （286個(gè)氨基酸），已找到包含這個(gè)序列的總體基因，但是針對(duì)SHARP的基因片段卻找不到。 The crystal structure of the Split End protein SHARP adds a new layer of complexity to proteins containing RNA recognition motifs 想要表達(dá)的蛋白質(zhì)序列 FGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREER 包含此序列的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuc ... ;amp;report=genbank， 非常感謝！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jing182: 金幣+5, ★★★很有幫助, 謝謝 2020-04-28 01:57:56
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這個(gè)就比對(duì)比較麻煩，不斷組合篩選 先把DNA序列通過網(wǎng)頁或軟件轉(zhuǎn)換成AA氨基酸序列 ctrl + F 比對(duì)相同氨基酸，找到比例位置，通過氨基酸位置，計(jì)算序列跨度，也就是氨基酸的個(gè)數(shù)x3就是跨越的基因序列長(zhǎng)度 然后通過氨基酸密碼子表，再核對(duì)check ，是否正確就行 費(fèi)時(shí) |
2樓2020-04-26 15:52:34
jing182
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3樓2020-04-28 02:00:53
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4樓2020-04-28 10:40:42
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