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悠哉2020銅蟲 (正式寫手)
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[交流]
高斯找過渡態(tài) 已有3人參與
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在找過渡態(tài)時,調了兩個結構,都找到過渡態(tài)。這兩個能量還會不一樣?那是不是還會存在能量更低的過渡態(tài),怎么解決? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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會的,比如說兩個過渡態(tài)的結構差不多,但鍵的方向不同;蛘哒f同一個基元反應有兩個過渡態(tài),且產物和反應物都相同。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |


銀蟲 (著名寫手)
銅蟲 (正式寫手)
版主 (著名寫手)
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不知道你調整的TS結構 是怎么調整的,是那種變化很大的調整,還就是把若干C-C單鍵旋轉一下那種調整。 找到多于一個過渡態(tài)的話,最好先跑一下IRC驗證一下,是否這些過渡態(tài)都是連接你的反應物產物的過渡態(tài)。畢竟反應路徑上,就某一步反應來說,也就是同一條勢能曲線上的兩個勢能曲線低點之間應該有且只有一個過渡態(tài)。不同的過渡態(tài)代表了不同的反應路徑。而不同的反應路徑一般代表了會有很不一樣的結構,和虛頻的振動模式。 一般的基元反應很少見能有非常多條反應路徑連接在同樣的的反應物和產物之間。 而就計算來說如果是用 opt=ts 得到的有一個虛頻的結構 ,那未必是連接你需要的,反應物和產物之間的那個過渡態(tài)。這時候需要IRC驗證一下。IRC跑完 兩端結構跟你的反應物產物結構相符才可以。 很可能調整了TS結構 跑出來IRC兩端的 反應物產物結構也發(fā)生了變化。 |
銅蟲 (正式寫手)
版主 (著名寫手)
銅蟲 (正式寫手)
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