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悠哉2020銅蟲 (正式寫手)
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[交流]
高斯找過渡態(tài) 已有3人參與
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在找過渡態(tài)時，調(diào)了兩個結(jié)構(gòu)，都找到過渡態(tài)。這兩個能量還會不一樣？那是不是還會存在能量更低的過渡態(tài)，怎么解決？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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會的，比如說兩個過渡態(tài)的結(jié)構(gòu)差不多，但鍵的方向不同�；蛘哒f同一個基元反應(yīng)有兩個過渡態(tài)，且產(chǎn)物和反應(yīng)物都相同。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2020-04-12 22:31:43
3樓2020-04-12 22:32:51
www1
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4樓2020-04-13 07:36:45
悠哉2020
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5樓2020-04-13 08:11:43
paramecium86
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不知道你調(diào)整的TS結(jié)構(gòu) 是怎么調(diào)整的，是那種變化很大的調(diào)整，還就是把若干C-C單鍵旋轉(zhuǎn)一下那種調(diào)整。 找到多于一個過渡態(tài)的話，最好先跑一下IRC驗證一下，是否這些過渡態(tài)都是連接你的反應(yīng)物產(chǎn)物的過渡態(tài)。畢竟反應(yīng)路徑上，就某一步反應(yīng)來說，也就是同一條勢能曲線上的兩個勢能曲線低點之間應(yīng)該有且只有一個過渡態(tài)。不同的過渡態(tài)代表了不同的反應(yīng)路徑。而不同的反應(yīng)路徑一般代表了會有很不一樣的結(jié)構(gòu)，和虛頻的振動模式。 一般的基元反應(yīng)很少見能有非常多條反應(yīng)路徑連接在同樣的的反應(yīng)物和產(chǎn)物之間。 而就計算來說如果是用 opt=ts 得到的有一個虛頻的結(jié)構(gòu) ，那未必是連接你需要的，反應(yīng)物和產(chǎn)物之間的那個過渡態(tài)。這時候需要IRC驗證一下。IRC跑完 兩端結(jié)構(gòu)跟你的反應(yīng)物產(chǎn)物結(jié)構(gòu)相符才可以。 很可能調(diào)整了TS結(jié)構(gòu) 跑出來IRC兩端的 反應(yīng)物產(chǎn)物結(jié)構(gòu)也發(fā)生了變化。 |
6樓2020-04-13 09:52:12
悠哉2020
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7樓2020-04-13 11:08:15
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8樓2020-04-13 11:37:51
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9樓2020-04-13 13:44:20
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